Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Clstn1Q9EPL2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Clstn1Q9EPL2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Clstn1Q9EPL2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Clstn1Q9EPL2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Clstn1Q9EPL2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Clstn1Q9EPL2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Clstn1Q9EPL2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Clstn1Q9EPL2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Clstn1Q9EPL2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Clstn1Q9EPL2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Clstn1Q9EPL2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Clstn1Q9EPL2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Clstn1Q9EPL2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Clstn1Q9EPL2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Clstn1Q9EPL2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Clstn1Q9EPL2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Clstn1Q9EPL2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Clstn1Q9EPL2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Clstn1Q9EPL2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Clstn1Q9EPL2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Clstn1Q9EPL2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Clstn1Q9EPL2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Clstn1Q9EPL2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Clstn1Q9EPL2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Clstn1Q9EPL2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Clstn1Q9EPL2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Clstn1Q9EPL2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Clstn1Q9EPL2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Clstn1Q9EPL2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Clstn1Q9EPL2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Clstn1Q9EPL2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Clstn1Q9EPL2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Clstn1Q9EPL2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Clstn1Q9EPL2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Clstn1Q9EPL2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Clstn1Q9EPL2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Clstn1Q9EPL2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Clstn1Q9EPL2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Clstn1Q9EPL2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Clstn1Q9EPL2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Clstn1Q9EPL2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Clstn1Q9EPL2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Clstn1Q9EPL2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Clstn1Q9EPL2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Clstn1Q9EPL2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Clstn1Q9EPL2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Clstn1Q9EPL2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Clstn1Q9EPL2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Clstn1Q9EPL2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Clstn1Q9EPL2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Clstn1Q9EPL2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Clstn1Q9EPL2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Clstn1Q9EPL2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Clstn1Q9EPL2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Clstn1Q9EPL2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Clstn1Q9EPL2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Clstn1Q9EPL2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Clstn1Q9EPL2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Clstn1Q9EPL2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Clstn1Q9EPL2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Clstn1Q9EPL2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Clstn1Q9EPL2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Clstn1Q9EPL2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Clstn1Q9EPL2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Clstn1Q9EPL2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Clstn1Q9EPL2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Clstn1Q9EPL2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Clstn1Q9EPL2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Clstn1Q9EPL2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Clstn1Q9EPL2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Clstn1Q9EPL2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Clstn1Q9EPL2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Clstn1Q9EPL2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Clstn1Q9EPL2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Clstn1Q9EPL2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Clstn1Q9EPL2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Clstn1Q9EPL2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Clstn1Q9EPL2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Clstn1Q9EPL2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Clstn1Q9EPL2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Clstn1Q9EPL2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Clstn1Q9EPL2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Clstn1Q9EPL2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Clstn1Q9EPL2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Clstn1Q9EPL2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Clstn1Q9EPL2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Clstn1Q9EPL2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Clstn1Q9EPL2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Clstn1Q9EPL2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Clstn1Q9EPL2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Clstn1Q9EPL2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Clstn1Q9EPL2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Clstn1Q9EPL2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Clstn1Q9EPL2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Clstn1Q9EPL2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Clstn1Q9EPL2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Clstn1Q9EPL2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Clstn1Q9EPL2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Clstn1Q9EPL2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms