Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rnft1Q9DCN7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rnft1Q9DCN7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rnft1Q9DCN7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rnft1Q9DCN7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rnft1Q9DCN7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rnft1Q9DCN7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rnft1Q9DCN7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rnft1Q9DCN7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rnft1Q9DCN7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rnft1Q9DCN7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rnft1Q9DCN7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rnft1Q9DCN7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rnft1Q9DCN7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rnft1Q9DCN7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rnft1Q9DCN7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rnft1Q9DCN7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rnft1Q9DCN7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rnft1Q9DCN7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rnft1Q9DCN7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rnft1Q9DCN7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rnft1Q9DCN7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rnft1Q9DCN7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rnft1Q9DCN7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rnft1Q9DCN7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rnft1Q9DCN7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rnft1Q9DCN7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rnft1Q9DCN7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Rnft1Q9DCN7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rnft1Q9DCN7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rnft1Q9DCN7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rnft1Q9DCN7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rnft1Q9DCN7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rnft1Q9DCN7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Rnft1Q9DCN7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnft1Q9DCN7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnft1Q9DCN7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnft1Q9DCN7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnft1Q9DCN7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnft1Q9DCN7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnft1Q9DCN7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnft1Q9DCN7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnft1Q9DCN7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rnft1Q9DCN7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rnft1Q9DCN7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rnft1Q9DCN7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rnft1Q9DCN7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rnft1Q9DCN7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rnft1Q9DCN7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rnft1Q9DCN7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rnft1Q9DCN7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rnft1Q9DCN7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnft1Q9DCN7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnft1Q9DCN7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnft1Q9DCN7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnft1Q9DCN7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnft1Q9DCN7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Rnft1Q9DCN7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rnft1Q9DCN7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rnft1Q9DCN7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnft1Q9DCN7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnft1Q9DCN7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnft1Q9DCN7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnft1Q9DCN7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnft1Q9DCN7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnft1Q9DCN7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnft1Q9DCN7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnft1Q9DCN7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnft1Q9DCN7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnft1Q9DCN7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnft1Q9DCN7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnft1Q9DCN7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnft1Q9DCN7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnft1Q9DCN7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnft1Q9DCN7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnft1Q9DCN7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnft1Q9DCN7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnft1Q9DCN7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rnft1Q9DCN7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rnft1Q9DCN7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnft1Q9DCN7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnft1Q9DCN7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnft1Q9DCN7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnft1Q9DCN7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnft1Q9DCN7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnft1Q9DCN7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnft1Q9DCN7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rnft1Q9DCN7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rnft1Q9DCN7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rnft1Q9DCN7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rnft1Q9DCN7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rnft1Q9DCN7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnft1Q9DCN7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnft1Q9DCN7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnft1Q9DCN7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnft1Q9DCN7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnft1Q9DCN7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnft1Q9DCN7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms