Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU0

Tm9sf1, Transmembrane 9 superfamily member 1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf1Q9DBU0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tm9sf1Q9DBU0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tm9sf1Q9DBU0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tm9sf1Q9DBU0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tm9sf1Q9DBU0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tm9sf1Q9DBU0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tm9sf1Q9DBU0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tm9sf1Q9DBU0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tm9sf1Q9DBU0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tm9sf1Q9DBU0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tm9sf1Q9DBU0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tm9sf1Q9DBU0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tm9sf1Q9DBU0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tm9sf1Q9DBU0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tm9sf1Q9DBU0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tm9sf1Q9DBU0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tm9sf1Q9DBU0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tm9sf1Q9DBU0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tm9sf1Q9DBU0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tm9sf1Q9DBU0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tm9sf1Q9DBU0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tm9sf1Q9DBU0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tm9sf1Q9DBU0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tm9sf1Q9DBU0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tm9sf1Q9DBU0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tm9sf1Q9DBU0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tm9sf1Q9DBU0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Tm9sf1Q9DBU0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tm9sf1Q9DBU0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tm9sf1Q9DBU0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tm9sf1Q9DBU0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tm9sf1Q9DBU0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tm9sf1Q9DBU0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tm9sf1Q9DBU0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tm9sf1Q9DBU0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tm9sf1Q9DBU0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tm9sf1Q9DBU0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tm9sf1Q9DBU0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tm9sf1Q9DBU0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tm9sf1Q9DBU0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tm9sf1Q9DBU0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tm9sf1Q9DBU0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tm9sf1Q9DBU0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tm9sf1Q9DBU0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tm9sf1Q9DBU0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tm9sf1Q9DBU0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tm9sf1Q9DBU0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tm9sf1Q9DBU0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tm9sf1Q9DBU0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tm9sf1Q9DBU0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tm9sf1Q9DBU0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tm9sf1Q9DBU0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tm9sf1Q9DBU0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tm9sf1Q9DBU0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tm9sf1Q9DBU0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tm9sf1Q9DBU0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Tm9sf1Q9DBU0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tm9sf1Q9DBU0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Tm9sf1Q9DBU0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tm9sf1Q9DBU0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tm9sf1Q9DBU0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tm9sf1Q9DBU0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tm9sf1Q9DBU0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tm9sf1Q9DBU0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tm9sf1Q9DBU0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tm9sf1Q9DBU0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tm9sf1Q9DBU0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tm9sf1Q9DBU0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tm9sf1Q9DBU0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tm9sf1Q9DBU0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tm9sf1Q9DBU0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tm9sf1Q9DBU0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tm9sf1Q9DBU0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tm9sf1Q9DBU0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tm9sf1Q9DBU0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tm9sf1Q9DBU0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tm9sf1Q9DBU0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tm9sf1Q9DBU0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tm9sf1Q9DBU0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tm9sf1Q9DBU0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tm9sf1Q9DBU0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tm9sf1Q9DBU0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tm9sf1Q9DBU0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tm9sf1Q9DBU0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tm9sf1Q9DBU0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tm9sf1Q9DBU0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tm9sf1Q9DBU0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tm9sf1Q9DBU0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tm9sf1Q9DBU0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tm9sf1Q9DBU0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tm9sf1Q9DBU0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tm9sf1Q9DBU0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tm9sf1Q9DBU0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tm9sf1Q9DBU0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tm9sf1Q9DBU0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tm9sf1Q9DBU0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Tm9sf1Q9DBU0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Tm9sf1Q9DBU0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tm9sf1Q9DBU0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tm9sf1Q9DBU0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms