Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pop5Q9DB28 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pop5Q9DB28 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pop5Q9DB28 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pop5Q9DB28 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pop5Q9DB28 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pop5Q9DB28 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pop5Q9DB28 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pop5Q9DB28 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pop5Q9DB28 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pop5Q9DB28 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pop5Q9DB28 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pop5Q9DB28 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pop5Q9DB28 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pop5Q9DB28 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pop5Q9DB28 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pop5Q9DB28 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Pop5Q9DB28 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pop5Q9DB28 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pop5Q9DB28 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pop5Q9DB28 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pop5Q9DB28 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pop5Q9DB28 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pop5Q9DB28 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pop5Q9DB28 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pop5Q9DB28 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pop5Q9DB28 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pop5Q9DB28 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pop5Q9DB28 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pop5Q9DB28 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pop5Q9DB28 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pop5Q9DB28 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pop5Q9DB28 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pop5Q9DB28 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pop5Q9DB28 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pop5Q9DB28 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pop5Q9DB28 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pop5Q9DB28 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pop5Q9DB28 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pop5Q9DB28 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pop5Q9DB28 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pop5Q9DB28 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pop5Q9DB28 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pop5Q9DB28 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pop5Q9DB28 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pop5Q9DB28 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pop5Q9DB28 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pop5Q9DB28 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pop5Q9DB28 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pop5Q9DB28 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pop5Q9DB28 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pop5Q9DB28 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pop5Q9DB28 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pop5Q9DB28 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pop5Q9DB28 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pop5Q9DB28 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pop5Q9DB28 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pop5Q9DB28 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pop5Q9DB28 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pop5Q9DB28 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pop5Q9DB28 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pop5Q9DB28 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pop5Q9DB28 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pop5Q9DB28 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pop5Q9DB28 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pop5Q9DB28 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pop5Q9DB28 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pop5Q9DB28 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pop5Q9DB28 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pop5Q9DB28 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pop5Q9DB28 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pop5Q9DB28 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pop5Q9DB28 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pop5Q9DB28 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pop5Q9DB28 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pop5Q9DB28 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pop5Q9DB28 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pop5Q9DB28 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pop5Q9DB28 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pop5Q9DB28 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pop5Q9DB28 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pop5Q9DB28 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pop5Q9DB28 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pop5Q9DB28 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pop5Q9DB28 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pop5Q9DB28 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pop5Q9DB28 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pop5Q9DB28 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Pop5Q9DB28 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pop5Q9DB28 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pop5Q9DB28 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pop5Q9DB28 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pop5Q9DB28 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pop5Q9DB28 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pop5Q9DB28 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pop5Q9DB28 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pop5Q9DB28 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pop5Q9DB28 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pop5Q9DB28 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pop5Q9DB28 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
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