Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL0

Smim23, Small integral membrane protein 23, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim23Q9DAL0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smim23Q9DAL0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smim23Q9DAL0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smim23Q9DAL0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smim23Q9DAL0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smim23Q9DAL0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smim23Q9DAL0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smim23Q9DAL0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smim23Q9DAL0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smim23Q9DAL0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smim23Q9DAL0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smim23Q9DAL0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smim23Q9DAL0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smim23Q9DAL0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Smim23Q9DAL0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smim23Q9DAL0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smim23Q9DAL0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smim23Q9DAL0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smim23Q9DAL0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smim23Q9DAL0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smim23Q9DAL0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smim23Q9DAL0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smim23Q9DAL0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smim23Q9DAL0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smim23Q9DAL0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Smim23Q9DAL0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smim23Q9DAL0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smim23Q9DAL0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smim23Q9DAL0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smim23Q9DAL0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smim23Q9DAL0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smim23Q9DAL0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smim23Q9DAL0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smim23Q9DAL0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smim23Q9DAL0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smim23Q9DAL0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smim23Q9DAL0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smim23Q9DAL0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Smim23Q9DAL0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smim23Q9DAL0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smim23Q9DAL0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smim23Q9DAL0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smim23Q9DAL0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smim23Q9DAL0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smim23Q9DAL0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smim23Q9DAL0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smim23Q9DAL0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smim23Q9DAL0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smim23Q9DAL0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smim23Q9DAL0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smim23Q9DAL0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smim23Q9DAL0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smim23Q9DAL0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smim23Q9DAL0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smim23Q9DAL0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smim23Q9DAL0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smim23Q9DAL0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smim23Q9DAL0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smim23Q9DAL0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smim23Q9DAL0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smim23Q9DAL0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smim23Q9DAL0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smim23Q9DAL0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smim23Q9DAL0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Smim23Q9DAL0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smim23Q9DAL0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smim23Q9DAL0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smim23Q9DAL0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smim23Q9DAL0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smim23Q9DAL0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smim23Q9DAL0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Smim23Q9DAL0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Smim23Q9DAL0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smim23Q9DAL0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smim23Q9DAL0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smim23Q9DAL0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smim23Q9DAL0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smim23Q9DAL0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smim23Q9DAL0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smim23Q9DAL0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smim23Q9DAL0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smim23Q9DAL0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smim23Q9DAL0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smim23Q9DAL0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smim23Q9DAL0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smim23Q9DAL0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smim23Q9DAL0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smim23Q9DAL0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smim23Q9DAL0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smim23Q9DAL0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smim23Q9DAL0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smim23Q9DAL0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smim23Q9DAL0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smim23Q9DAL0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smim23Q9DAL0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smim23Q9DAL0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smim23Q9DAL0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smim23Q9DAL0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smim23Q9DAL0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smim23Q9DAL0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms