Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9T8

Efhc1, EF-hand domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhc1Q9D9T8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Efhc1Q9D9T8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Efhc1Q9D9T8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Efhc1Q9D9T8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Efhc1Q9D9T8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Efhc1Q9D9T8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Efhc1Q9D9T8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Efhc1Q9D9T8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Efhc1Q9D9T8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Efhc1Q9D9T8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Efhc1Q9D9T8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Efhc1Q9D9T8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Efhc1Q9D9T8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Efhc1Q9D9T8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Efhc1Q9D9T8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Efhc1Q9D9T8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Efhc1Q9D9T8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Efhc1Q9D9T8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Efhc1Q9D9T8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Efhc1Q9D9T8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Efhc1Q9D9T8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Efhc1Q9D9T8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Efhc1Q9D9T8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Efhc1Q9D9T8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Efhc1Q9D9T8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Efhc1Q9D9T8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Efhc1Q9D9T8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Efhc1Q9D9T8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Efhc1Q9D9T8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Efhc1Q9D9T8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Efhc1Q9D9T8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Efhc1Q9D9T8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Efhc1Q9D9T8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Efhc1Q9D9T8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Efhc1Q9D9T8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Efhc1Q9D9T8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Efhc1Q9D9T8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Efhc1Q9D9T8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Efhc1Q9D9T8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Efhc1Q9D9T8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Efhc1Q9D9T8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Efhc1Q9D9T8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Efhc1Q9D9T8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Efhc1Q9D9T8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Efhc1Q9D9T8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Efhc1Q9D9T8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Efhc1Q9D9T8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Efhc1Q9D9T8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Efhc1Q9D9T8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Efhc1Q9D9T8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Efhc1Q9D9T8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Efhc1Q9D9T8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Efhc1Q9D9T8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Efhc1Q9D9T8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Efhc1Q9D9T8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Efhc1Q9D9T8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Efhc1Q9D9T8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Efhc1Q9D9T8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Efhc1Q9D9T8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Efhc1Q9D9T8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Efhc1Q9D9T8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Efhc1Q9D9T8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Efhc1Q9D9T8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Efhc1Q9D9T8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Efhc1Q9D9T8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Efhc1Q9D9T8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Efhc1Q9D9T8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Efhc1Q9D9T8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Efhc1Q9D9T8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Efhc1Q9D9T8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Efhc1Q9D9T8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Efhc1Q9D9T8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Efhc1Q9D9T8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Efhc1Q9D9T8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Efhc1Q9D9T8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Efhc1Q9D9T8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Efhc1Q9D9T8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Efhc1Q9D9T8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Efhc1Q9D9T8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Efhc1Q9D9T8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Efhc1Q9D9T8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Efhc1Q9D9T8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Efhc1Q9D9T8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Efhc1Q9D9T8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Efhc1Q9D9T8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Efhc1Q9D9T8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Efhc1Q9D9T8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Efhc1Q9D9T8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Efhc1Q9D9T8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Efhc1Q9D9T8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Efhc1Q9D9T8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Efhc1Q9D9T8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Efhc1Q9D9T8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Efhc1Q9D9T8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Efhc1Q9D9T8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Efhc1Q9D9T8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Efhc1Q9D9T8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Efhc1Q9D9T8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Efhc1Q9D9T8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Efhc1Q9D9T8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms