Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N5

Cib4, Calcium and integrin-binding family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib4Q9D9N5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cib4Q9D9N5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cib4Q9D9N5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cib4Q9D9N5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cib4Q9D9N5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cib4Q9D9N5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cib4Q9D9N5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cib4Q9D9N5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cib4Q9D9N5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cib4Q9D9N5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cib4Q9D9N5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cib4Q9D9N5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cib4Q9D9N5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cib4Q9D9N5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cib4Q9D9N5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cib4Q9D9N5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cib4Q9D9N5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cib4Q9D9N5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cib4Q9D9N5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cib4Q9D9N5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cib4Q9D9N5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cib4Q9D9N5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cib4Q9D9N5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cib4Q9D9N5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cib4Q9D9N5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cib4Q9D9N5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cib4Q9D9N5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cib4Q9D9N5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cib4Q9D9N5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cib4Q9D9N5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cib4Q9D9N5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cib4Q9D9N5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cib4Q9D9N5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cib4Q9D9N5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cib4Q9D9N5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cib4Q9D9N5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cib4Q9D9N5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cib4Q9D9N5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cib4Q9D9N5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cib4Q9D9N5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cib4Q9D9N5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cib4Q9D9N5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cib4Q9D9N5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cib4Q9D9N5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cib4Q9D9N5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cib4Q9D9N5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cib4Q9D9N5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cib4Q9D9N5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cib4Q9D9N5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cib4Q9D9N5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cib4Q9D9N5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cib4Q9D9N5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cib4Q9D9N5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cib4Q9D9N5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cib4Q9D9N5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cib4Q9D9N5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cib4Q9D9N5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cib4Q9D9N5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cib4Q9D9N5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cib4Q9D9N5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cib4Q9D9N5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cib4Q9D9N5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cib4Q9D9N5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cib4Q9D9N5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cib4Q9D9N5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cib4Q9D9N5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cib4Q9D9N5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cib4Q9D9N5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cib4Q9D9N5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cib4Q9D9N5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cib4Q9D9N5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cib4Q9D9N5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cib4Q9D9N5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cib4Q9D9N5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cib4Q9D9N5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cib4Q9D9N5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cib4Q9D9N5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cib4Q9D9N5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Cib4Q9D9N5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cib4Q9D9N5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cib4Q9D9N5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cib4Q9D9N5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cib4Q9D9N5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cib4Q9D9N5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cib4Q9D9N5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cib4Q9D9N5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cib4Q9D9N5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cib4Q9D9N5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cib4Q9D9N5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cib4Q9D9N5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cib4Q9D9N5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cib4Q9D9N5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cib4Q9D9N5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cib4Q9D9N5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cib4Q9D9N5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cib4Q9D9N5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cib4Q9D9N5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cib4Q9D9N5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cib4Q9D9N5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cib4Q9D9N5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms