Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tmco5aQ9D9D5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tmco5aQ9D9D5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tmco5aQ9D9D5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tmco5aQ9D9D5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmco5aQ9D9D5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmco5aQ9D9D5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmco5aQ9D9D5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmco5aQ9D9D5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmco5aQ9D9D5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmco5aQ9D9D5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmco5aQ9D9D5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tmco5aQ9D9D5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tmco5aQ9D9D5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Tmco5aQ9D9D5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tmco5aQ9D9D5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tmco5aQ9D9D5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tmco5aQ9D9D5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Tmco5aQ9D9D5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tmco5aQ9D9D5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tmco5aQ9D9D5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tmco5aQ9D9D5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmco5aQ9D9D5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tmco5aQ9D9D5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmco5aQ9D9D5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmco5aQ9D9D5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmco5aQ9D9D5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmco5aQ9D9D5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmco5aQ9D9D5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmco5aQ9D9D5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmco5aQ9D9D5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmco5aQ9D9D5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmco5aQ9D9D5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tmco5aQ9D9D5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tmco5aQ9D9D5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tmco5aQ9D9D5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tmco5aQ9D9D5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tmco5aQ9D9D5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tmco5aQ9D9D5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tmco5aQ9D9D5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmco5aQ9D9D5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmco5aQ9D9D5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmco5aQ9D9D5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmco5aQ9D9D5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmco5aQ9D9D5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmco5aQ9D9D5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmco5aQ9D9D5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmco5aQ9D9D5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmco5aQ9D9D5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tmco5aQ9D9D5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tmco5aQ9D9D5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tmco5aQ9D9D5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tmco5aQ9D9D5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Tmco5aQ9D9D5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Tmco5aQ9D9D5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Tmco5aQ9D9D5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tmco5aQ9D9D5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tmco5aQ9D9D5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tmco5aQ9D9D5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tmco5aQ9D9D5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tmco5aQ9D9D5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmco5aQ9D9D5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmco5aQ9D9D5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmco5aQ9D9D5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tmco5aQ9D9D5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tmco5aQ9D9D5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tmco5aQ9D9D5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tmco5aQ9D9D5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tmco5aQ9D9D5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tmco5aQ9D9D5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tmco5aQ9D9D5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmco5aQ9D9D5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmco5aQ9D9D5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmco5aQ9D9D5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmco5aQ9D9D5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmco5aQ9D9D5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmco5aQ9D9D5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmco5aQ9D9D5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmco5aQ9D9D5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmco5aQ9D9D5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Tmco5aQ9D9D5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tmco5aQ9D9D5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tmco5aQ9D9D5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tmco5aQ9D9D5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tmco5aQ9D9D5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tmco5aQ9D9D5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tmco5aQ9D9D5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tmco5aQ9D9D5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tmco5aQ9D9D5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tmco5aQ9D9D5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tmco5aQ9D9D5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tmco5aQ9D9D5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tmco5aQ9D9D5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tmco5aQ9D9D5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tmco5aQ9D9D5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tmco5aQ9D9D5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tmco5aQ9D9D5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tmco5aQ9D9D5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tmco5aQ9D9D5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tmco5aQ9D9D5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms