Protein–RNA interactions for Protein: Q9D995

Cntd1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntd1Q9D995 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cntd1Q9D995 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cntd1Q9D995 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cntd1Q9D995 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cntd1Q9D995 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cntd1Q9D995 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cntd1Q9D995 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cntd1Q9D995 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cntd1Q9D995 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cntd1Q9D995 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cntd1Q9D995 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cntd1Q9D995 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cntd1Q9D995 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cntd1Q9D995 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cntd1Q9D995 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cntd1Q9D995 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cntd1Q9D995 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cntd1Q9D995 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cntd1Q9D995 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cntd1Q9D995 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cntd1Q9D995 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cntd1Q9D995 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cntd1Q9D995 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cntd1Q9D995 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cntd1Q9D995 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cntd1Q9D995 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cntd1Q9D995 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cntd1Q9D995 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cntd1Q9D995 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cntd1Q9D995 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cntd1Q9D995 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cntd1Q9D995 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cntd1Q9D995 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cntd1Q9D995 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cntd1Q9D995 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Cntd1Q9D995 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cntd1Q9D995 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cntd1Q9D995 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cntd1Q9D995 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cntd1Q9D995 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cntd1Q9D995 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cntd1Q9D995 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cntd1Q9D995 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cntd1Q9D995 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cntd1Q9D995 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cntd1Q9D995 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cntd1Q9D995 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cntd1Q9D995 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cntd1Q9D995 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cntd1Q9D995 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cntd1Q9D995 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cntd1Q9D995 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cntd1Q9D995 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cntd1Q9D995 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cntd1Q9D995 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cntd1Q9D995 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cntd1Q9D995 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cntd1Q9D995 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cntd1Q9D995 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cntd1Q9D995 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cntd1Q9D995 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cntd1Q9D995 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cntd1Q9D995 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cntd1Q9D995 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cntd1Q9D995 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cntd1Q9D995 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cntd1Q9D995 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cntd1Q9D995 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cntd1Q9D995 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cntd1Q9D995 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cntd1Q9D995 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cntd1Q9D995 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cntd1Q9D995 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cntd1Q9D995 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cntd1Q9D995 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cntd1Q9D995 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cntd1Q9D995 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cntd1Q9D995 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cntd1Q9D995 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cntd1Q9D995 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cntd1Q9D995 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cntd1Q9D995 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cntd1Q9D995 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cntd1Q9D995 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cntd1Q9D995 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cntd1Q9D995 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cntd1Q9D995 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cntd1Q9D995 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cntd1Q9D995 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cntd1Q9D995 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cntd1Q9D995 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cntd1Q9D995 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cntd1Q9D995 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cntd1Q9D995 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cntd1Q9D995 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cntd1Q9D995 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cntd1Q9D995 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cntd1Q9D995 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cntd1Q9D995 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cntd1Q9D995 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 161.7 ms