Protein–RNA interactions for Protein: Q9D968

Hcfc2, Host cell factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcfc2Q9D968 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hcfc2Q9D968 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hcfc2Q9D968 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hcfc2Q9D968 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hcfc2Q9D968 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hcfc2Q9D968 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hcfc2Q9D968 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hcfc2Q9D968 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hcfc2Q9D968 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hcfc2Q9D968 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hcfc2Q9D968 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hcfc2Q9D968 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hcfc2Q9D968 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hcfc2Q9D968 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hcfc2Q9D968 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hcfc2Q9D968 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hcfc2Q9D968 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hcfc2Q9D968 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hcfc2Q9D968 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hcfc2Q9D968 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hcfc2Q9D968 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hcfc2Q9D968 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hcfc2Q9D968 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hcfc2Q9D968 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hcfc2Q9D968 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hcfc2Q9D968 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hcfc2Q9D968 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hcfc2Q9D968 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hcfc2Q9D968 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hcfc2Q9D968 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hcfc2Q9D968 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Hcfc2Q9D968 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hcfc2Q9D968 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hcfc2Q9D968 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hcfc2Q9D968 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hcfc2Q9D968 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hcfc2Q9D968 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Hcfc2Q9D968 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hcfc2Q9D968 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hcfc2Q9D968 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Hcfc2Q9D968 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Hcfc2Q9D968 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hcfc2Q9D968 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hcfc2Q9D968 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hcfc2Q9D968 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Hcfc2Q9D968 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hcfc2Q9D968 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hcfc2Q9D968 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hcfc2Q9D968 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hcfc2Q9D968 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hcfc2Q9D968 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hcfc2Q9D968 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hcfc2Q9D968 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hcfc2Q9D968 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hcfc2Q9D968 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hcfc2Q9D968 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hcfc2Q9D968 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hcfc2Q9D968 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hcfc2Q9D968 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hcfc2Q9D968 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hcfc2Q9D968 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hcfc2Q9D968 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hcfc2Q9D968 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hcfc2Q9D968 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hcfc2Q9D968 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hcfc2Q9D968 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hcfc2Q9D968 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hcfc2Q9D968 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hcfc2Q9D968 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hcfc2Q9D968 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hcfc2Q9D968 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hcfc2Q9D968 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hcfc2Q9D968 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hcfc2Q9D968 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hcfc2Q9D968 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hcfc2Q9D968 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hcfc2Q9D968 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hcfc2Q9D968 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hcfc2Q9D968 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hcfc2Q9D968 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hcfc2Q9D968 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hcfc2Q9D968 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hcfc2Q9D968 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hcfc2Q9D968 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hcfc2Q9D968 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hcfc2Q9D968 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hcfc2Q9D968 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hcfc2Q9D968 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hcfc2Q9D968 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hcfc2Q9D968 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hcfc2Q9D968 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hcfc2Q9D968 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hcfc2Q9D968 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hcfc2Q9D968 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hcfc2Q9D968 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hcfc2Q9D968 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hcfc2Q9D968 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hcfc2Q9D968 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hcfc2Q9D968 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hcfc2Q9D968 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms