Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rexo2Q9D8S4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rexo2Q9D8S4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rexo2Q9D8S4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rexo2Q9D8S4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rexo2Q9D8S4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rexo2Q9D8S4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Rexo2Q9D8S4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rexo2Q9D8S4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rexo2Q9D8S4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rexo2Q9D8S4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rexo2Q9D8S4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rexo2Q9D8S4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rexo2Q9D8S4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Rexo2Q9D8S4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rexo2Q9D8S4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rexo2Q9D8S4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rexo2Q9D8S4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rexo2Q9D8S4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rexo2Q9D8S4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rexo2Q9D8S4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rexo2Q9D8S4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rexo2Q9D8S4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rexo2Q9D8S4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rexo2Q9D8S4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rexo2Q9D8S4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rexo2Q9D8S4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rexo2Q9D8S4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rexo2Q9D8S4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rexo2Q9D8S4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rexo2Q9D8S4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rexo2Q9D8S4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rexo2Q9D8S4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rexo2Q9D8S4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rexo2Q9D8S4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rexo2Q9D8S4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rexo2Q9D8S4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rexo2Q9D8S4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rexo2Q9D8S4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rexo2Q9D8S4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rexo2Q9D8S4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rexo2Q9D8S4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rexo2Q9D8S4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rexo2Q9D8S4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rexo2Q9D8S4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rexo2Q9D8S4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rexo2Q9D8S4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rexo2Q9D8S4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rexo2Q9D8S4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rexo2Q9D8S4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rexo2Q9D8S4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rexo2Q9D8S4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rexo2Q9D8S4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rexo2Q9D8S4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rexo2Q9D8S4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rexo2Q9D8S4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rexo2Q9D8S4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rexo2Q9D8S4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rexo2Q9D8S4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rexo2Q9D8S4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rexo2Q9D8S4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rexo2Q9D8S4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rexo2Q9D8S4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rexo2Q9D8S4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rexo2Q9D8S4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rexo2Q9D8S4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rexo2Q9D8S4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rexo2Q9D8S4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rexo2Q9D8S4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rexo2Q9D8S4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rexo2Q9D8S4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rexo2Q9D8S4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rexo2Q9D8S4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Rexo2Q9D8S4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Rexo2Q9D8S4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rexo2Q9D8S4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rexo2Q9D8S4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rexo2Q9D8S4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rexo2Q9D8S4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rexo2Q9D8S4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rexo2Q9D8S4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rexo2Q9D8S4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rexo2Q9D8S4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rexo2Q9D8S4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Rexo2Q9D8S4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Rexo2Q9D8S4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rexo2Q9D8S4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rexo2Q9D8S4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Rexo2Q9D8S4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rexo2Q9D8S4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rexo2Q9D8S4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rexo2Q9D8S4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rexo2Q9D8S4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rexo2Q9D8S4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Rexo2Q9D8S4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rexo2Q9D8S4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rexo2Q9D8S4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rexo2Q9D8S4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rexo2Q9D8S4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rexo2Q9D8S4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms