Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N1

Uncharacterized protein C11orf24 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8N1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9D8N1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
Q9D8N1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9D8N1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9D8N1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9D8N1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9D8N1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9D8N1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9D8N1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9D8N1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9D8N1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9D8N1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9D8N1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9D8N1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Q9D8N1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Q9D8N1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q9D8N1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q9D8N1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q9D8N1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9D8N1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9D8N1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9D8N1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9D8N1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9D8N1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9D8N1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9D8N1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9D8N1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9D8N1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9D8N1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9D8N1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Q9D8N1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9D8N1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9D8N1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9D8N1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9D8N1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9D8N1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9D8N1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9D8N1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9D8N1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9D8N1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9D8N1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9D8N1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9D8N1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q9D8N1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q9D8N1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q9D8N1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q9D8N1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q9D8N1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q9D8N1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Q9D8N1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q9D8N1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q9D8N1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q9D8N1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Q9D8N1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Q9D8N1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Q9D8N1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q9D8N1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Q9D8N1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Q9D8N1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Q9D8N1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Q9D8N1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Q9D8N1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Q9D8N1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Q9D8N1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Q9D8N1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Q9D8N1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Q9D8N1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Q9D8N1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Q9D8N1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Q9D8N1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Q9D8N1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Q9D8N1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Q9D8N1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Q9D8N1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Q9D8N1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Q9D8N1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Q9D8N1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Q9D8N1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Q9D8N1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Q9D8N1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Q9D8N1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Q9D8N1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Q9D8N1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Q9D8N1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Q9D8N1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Q9D8N1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Q9D8N1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Q9D8N1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Q9D8N1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Q9D8N1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Q9D8N1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q9D8N1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q9D8N1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Q9D8N1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Q9D8N1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q9D8N1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q9D8N1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q9D8N1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q9D8N1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q9D8N1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms