Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3T1

4933436I01Rik, RIKEN cDNA 4933436I01, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933436I01RikQ9D3T1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4933436I01RikQ9D3T1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
4933436I01RikQ9D3T1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
4933436I01RikQ9D3T1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
4933436I01RikQ9D3T1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
4933436I01RikQ9D3T1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
4933436I01RikQ9D3T1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
4933436I01RikQ9D3T1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
4933436I01RikQ9D3T1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
4933436I01RikQ9D3T1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
4933436I01RikQ9D3T1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4933436I01RikQ9D3T1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
4933436I01RikQ9D3T1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4933436I01RikQ9D3T1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4933436I01RikQ9D3T1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4933436I01RikQ9D3T1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4933436I01RikQ9D3T1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4933436I01RikQ9D3T1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
4933436I01RikQ9D3T1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4933436I01RikQ9D3T1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4933436I01RikQ9D3T1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
4933436I01RikQ9D3T1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
4933436I01RikQ9D3T1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4933436I01RikQ9D3T1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4933436I01RikQ9D3T1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4933436I01RikQ9D3T1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
4933436I01RikQ9D3T1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4933436I01RikQ9D3T1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4933436I01RikQ9D3T1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4933436I01RikQ9D3T1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
4933436I01RikQ9D3T1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
4933436I01RikQ9D3T1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4933436I01RikQ9D3T1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
4933436I01RikQ9D3T1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
4933436I01RikQ9D3T1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
4933436I01RikQ9D3T1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4933436I01RikQ9D3T1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4933436I01RikQ9D3T1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4933436I01RikQ9D3T1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
4933436I01RikQ9D3T1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4933436I01RikQ9D3T1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4933436I01RikQ9D3T1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
4933436I01RikQ9D3T1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4933436I01RikQ9D3T1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4933436I01RikQ9D3T1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4933436I01RikQ9D3T1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
4933436I01RikQ9D3T1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4933436I01RikQ9D3T1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
4933436I01RikQ9D3T1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4933436I01RikQ9D3T1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4933436I01RikQ9D3T1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4933436I01RikQ9D3T1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4933436I01RikQ9D3T1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
4933436I01RikQ9D3T1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
4933436I01RikQ9D3T1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
4933436I01RikQ9D3T1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
4933436I01RikQ9D3T1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
4933436I01RikQ9D3T1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4933436I01RikQ9D3T1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4933436I01RikQ9D3T1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4933436I01RikQ9D3T1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4933436I01RikQ9D3T1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4933436I01RikQ9D3T1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
4933436I01RikQ9D3T1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
4933436I01RikQ9D3T1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
4933436I01RikQ9D3T1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
4933436I01RikQ9D3T1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
4933436I01RikQ9D3T1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4933436I01RikQ9D3T1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
4933436I01RikQ9D3T1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4933436I01RikQ9D3T1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4933436I01RikQ9D3T1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4933436I01RikQ9D3T1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
4933436I01RikQ9D3T1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
4933436I01RikQ9D3T1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
4933436I01RikQ9D3T1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
4933436I01RikQ9D3T1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4933436I01RikQ9D3T1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
4933436I01RikQ9D3T1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4933436I01RikQ9D3T1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
4933436I01RikQ9D3T1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
4933436I01RikQ9D3T1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
4933436I01RikQ9D3T1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
4933436I01RikQ9D3T1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
4933436I01RikQ9D3T1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
4933436I01RikQ9D3T1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
4933436I01RikQ9D3T1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
4933436I01RikQ9D3T1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
4933436I01RikQ9D3T1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
4933436I01RikQ9D3T1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
4933436I01RikQ9D3T1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
4933436I01RikQ9D3T1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
4933436I01RikQ9D3T1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
4933436I01RikQ9D3T1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
4933436I01RikQ9D3T1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
4933436I01RikQ9D3T1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4933436I01RikQ9D3T1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4933436I01RikQ9D3T1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4933436I01RikQ9D3T1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
4933436I01RikQ9D3T1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms