Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3B1

Hacd2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd2Q9D3B1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hacd2Q9D3B1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hacd2Q9D3B1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hacd2Q9D3B1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hacd2Q9D3B1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hacd2Q9D3B1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hacd2Q9D3B1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hacd2Q9D3B1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hacd2Q9D3B1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hacd2Q9D3B1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hacd2Q9D3B1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hacd2Q9D3B1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hacd2Q9D3B1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hacd2Q9D3B1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hacd2Q9D3B1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hacd2Q9D3B1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hacd2Q9D3B1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Hacd2Q9D3B1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hacd2Q9D3B1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Hacd2Q9D3B1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hacd2Q9D3B1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hacd2Q9D3B1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hacd2Q9D3B1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hacd2Q9D3B1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hacd2Q9D3B1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hacd2Q9D3B1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hacd2Q9D3B1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hacd2Q9D3B1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hacd2Q9D3B1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hacd2Q9D3B1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hacd2Q9D3B1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hacd2Q9D3B1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hacd2Q9D3B1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hacd2Q9D3B1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hacd2Q9D3B1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hacd2Q9D3B1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hacd2Q9D3B1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hacd2Q9D3B1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hacd2Q9D3B1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hacd2Q9D3B1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hacd2Q9D3B1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hacd2Q9D3B1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hacd2Q9D3B1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hacd2Q9D3B1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hacd2Q9D3B1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hacd2Q9D3B1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hacd2Q9D3B1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hacd2Q9D3B1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hacd2Q9D3B1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hacd2Q9D3B1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hacd2Q9D3B1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hacd2Q9D3B1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hacd2Q9D3B1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hacd2Q9D3B1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hacd2Q9D3B1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hacd2Q9D3B1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hacd2Q9D3B1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hacd2Q9D3B1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hacd2Q9D3B1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hacd2Q9D3B1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hacd2Q9D3B1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hacd2Q9D3B1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hacd2Q9D3B1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hacd2Q9D3B1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hacd2Q9D3B1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hacd2Q9D3B1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hacd2Q9D3B1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hacd2Q9D3B1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hacd2Q9D3B1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hacd2Q9D3B1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hacd2Q9D3B1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hacd2Q9D3B1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hacd2Q9D3B1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hacd2Q9D3B1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hacd2Q9D3B1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hacd2Q9D3B1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hacd2Q9D3B1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hacd2Q9D3B1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hacd2Q9D3B1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hacd2Q9D3B1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hacd2Q9D3B1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hacd2Q9D3B1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Hacd2Q9D3B1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hacd2Q9D3B1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hacd2Q9D3B1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hacd2Q9D3B1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hacd2Q9D3B1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hacd2Q9D3B1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hacd2Q9D3B1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hacd2Q9D3B1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hacd2Q9D3B1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hacd2Q9D3B1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hacd2Q9D3B1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hacd2Q9D3B1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hacd2Q9D3B1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hacd2Q9D3B1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hacd2Q9D3B1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hacd2Q9D3B1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hacd2Q9D3B1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hacd2Q9D3B1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms