Protein–RNA interactions for Protein: Q9D361

Snrnp48, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 48 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp48Q9D361 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snrnp48Q9D361 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snrnp48Q9D361 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snrnp48Q9D361 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snrnp48Q9D361 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snrnp48Q9D361 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Snrnp48Q9D361 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Snrnp48Q9D361 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snrnp48Q9D361 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snrnp48Q9D361 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snrnp48Q9D361 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snrnp48Q9D361 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snrnp48Q9D361 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snrnp48Q9D361 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snrnp48Q9D361 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snrnp48Q9D361 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snrnp48Q9D361 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snrnp48Q9D361 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snrnp48Q9D361 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Snrnp48Q9D361 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snrnp48Q9D361 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snrnp48Q9D361 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snrnp48Q9D361 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snrnp48Q9D361 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snrnp48Q9D361 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snrnp48Q9D361 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snrnp48Q9D361 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snrnp48Q9D361 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snrnp48Q9D361 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snrnp48Q9D361 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snrnp48Q9D361 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snrnp48Q9D361 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snrnp48Q9D361 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snrnp48Q9D361 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snrnp48Q9D361 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snrnp48Q9D361 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snrnp48Q9D361 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Snrnp48Q9D361 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snrnp48Q9D361 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snrnp48Q9D361 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snrnp48Q9D361 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snrnp48Q9D361 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snrnp48Q9D361 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snrnp48Q9D361 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snrnp48Q9D361 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snrnp48Q9D361 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Snrnp48Q9D361 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snrnp48Q9D361 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snrnp48Q9D361 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snrnp48Q9D361 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snrnp48Q9D361 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Snrnp48Q9D361 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Snrnp48Q9D361 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Snrnp48Q9D361 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snrnp48Q9D361 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snrnp48Q9D361 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snrnp48Q9D361 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snrnp48Q9D361 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snrnp48Q9D361 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snrnp48Q9D361 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snrnp48Q9D361 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snrnp48Q9D361 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snrnp48Q9D361 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Snrnp48Q9D361 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snrnp48Q9D361 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snrnp48Q9D361 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snrnp48Q9D361 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snrnp48Q9D361 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Snrnp48Q9D361 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snrnp48Q9D361 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snrnp48Q9D361 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snrnp48Q9D361 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snrnp48Q9D361 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snrnp48Q9D361 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snrnp48Q9D361 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snrnp48Q9D361 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snrnp48Q9D361 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snrnp48Q9D361 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snrnp48Q9D361 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snrnp48Q9D361 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snrnp48Q9D361 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snrnp48Q9D361 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snrnp48Q9D361 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snrnp48Q9D361 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snrnp48Q9D361 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snrnp48Q9D361 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snrnp48Q9D361 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snrnp48Q9D361 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snrnp48Q9D361 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snrnp48Q9D361 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Snrnp48Q9D361 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snrnp48Q9D361 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snrnp48Q9D361 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snrnp48Q9D361 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snrnp48Q9D361 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snrnp48Q9D361 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snrnp48Q9D361 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Snrnp48Q9D361 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snrnp48Q9D361 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snrnp48Q9D361 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms