Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Q9D2Q3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Q9D2Q3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Q9D2Q3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Q9D2Q3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Q9D2Q3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Q9D2Q3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Q9D2Q3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Q9D2Q3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Q9D2Q3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Q9D2Q3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Q9D2Q3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Q9D2Q3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Q9D2Q3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Q9D2Q3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Q9D2Q3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Q9D2Q3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Q9D2Q3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Q9D2Q3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Q9D2Q3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Q9D2Q3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Q9D2Q3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Q9D2Q3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Q9D2Q3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Q9D2Q3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Q9D2Q3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Q9D2Q3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Q9D2Q3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Q9D2Q3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Q9D2Q3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Q9D2Q3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Q9D2Q3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Q9D2Q3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Q9D2Q3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Q9D2Q3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Q9D2Q3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Q9D2Q3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Q9D2Q3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Q9D2Q3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Q9D2Q3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Q9D2Q3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Q9D2Q3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Q9D2Q3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Q9D2Q3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Q9D2Q3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Q9D2Q3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Q9D2Q3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Q9D2Q3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Q9D2Q3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Q9D2Q3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Q9D2Q3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Q9D2Q3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Q9D2Q3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Q9D2Q3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Q9D2Q3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Q9D2Q3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Q9D2Q3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Q9D2Q3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Q9D2Q3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Q9D2Q3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Q9D2Q3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Q9D2Q3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Q9D2Q3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Q9D2Q3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Q9D2Q3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Q9D2Q3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Q9D2Q3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Q9D2Q3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Q9D2Q3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Q9D2Q3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Q9D2Q3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Q9D2Q3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Q9D2Q3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Q9D2Q3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Q9D2Q3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Q9D2Q3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Q9D2Q3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Q9D2Q3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Q9D2Q3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Q9D2Q3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Q9D2Q3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Q9D2Q3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Q9D2Q3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Q9D2Q3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Q9D2Q3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Q9D2Q3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Q9D2Q3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Q9D2Q3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Q9D2Q3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Q9D2Q3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Q9D2Q3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Q9D2Q3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Q9D2Q3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Q9D2Q3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Q9D2Q3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Q9D2Q3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Q9D2Q3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Q9D2Q3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Q9D2Q3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Q9D2Q3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms