Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R4

Ddx56, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx56Q9D0R4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ddx56Q9D0R4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ddx56Q9D0R4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ddx56Q9D0R4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Ddx56Q9D0R4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ddx56Q9D0R4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ddx56Q9D0R4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ddx56Q9D0R4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Ddx56Q9D0R4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ddx56Q9D0R4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ddx56Q9D0R4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ddx56Q9D0R4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ddx56Q9D0R4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ddx56Q9D0R4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ddx56Q9D0R4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ddx56Q9D0R4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ddx56Q9D0R4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ddx56Q9D0R4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ddx56Q9D0R4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ddx56Q9D0R4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ddx56Q9D0R4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ddx56Q9D0R4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ddx56Q9D0R4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ddx56Q9D0R4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Ddx56Q9D0R4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ddx56Q9D0R4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ddx56Q9D0R4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ddx56Q9D0R4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ddx56Q9D0R4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ddx56Q9D0R4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ddx56Q9D0R4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ddx56Q9D0R4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ddx56Q9D0R4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ddx56Q9D0R4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ddx56Q9D0R4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Ddx56Q9D0R4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ddx56Q9D0R4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ddx56Q9D0R4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ddx56Q9D0R4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ddx56Q9D0R4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ddx56Q9D0R4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ddx56Q9D0R4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Ddx56Q9D0R4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ddx56Q9D0R4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ddx56Q9D0R4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ddx56Q9D0R4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ddx56Q9D0R4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ddx56Q9D0R4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ddx56Q9D0R4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ddx56Q9D0R4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ddx56Q9D0R4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ddx56Q9D0R4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ddx56Q9D0R4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ddx56Q9D0R4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ddx56Q9D0R4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ddx56Q9D0R4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ddx56Q9D0R4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ddx56Q9D0R4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ddx56Q9D0R4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ddx56Q9D0R4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ddx56Q9D0R4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ddx56Q9D0R4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ddx56Q9D0R4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ddx56Q9D0R4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ddx56Q9D0R4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ddx56Q9D0R4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ddx56Q9D0R4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ddx56Q9D0R4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ddx56Q9D0R4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ddx56Q9D0R4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ddx56Q9D0R4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ddx56Q9D0R4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ddx56Q9D0R4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ddx56Q9D0R4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ddx56Q9D0R4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ddx56Q9D0R4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ddx56Q9D0R4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ddx56Q9D0R4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ddx56Q9D0R4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ddx56Q9D0R4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ddx56Q9D0R4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ddx56Q9D0R4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ddx56Q9D0R4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ddx56Q9D0R4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ddx56Q9D0R4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ddx56Q9D0R4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ddx56Q9D0R4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ddx56Q9D0R4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ddx56Q9D0R4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ddx56Q9D0R4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ddx56Q9D0R4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ddx56Q9D0R4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ddx56Q9D0R4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ddx56Q9D0R4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ddx56Q9D0R4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ddx56Q9D0R4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ddx56Q9D0R4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ddx56Q9D0R4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ddx56Q9D0R4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ddx56Q9D0R4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms