Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M1

Prpsap1, Phosphoribosyl pyrophosphate synthase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpsap1Q9D0M1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prpsap1Q9D0M1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prpsap1Q9D0M1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prpsap1Q9D0M1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prpsap1Q9D0M1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prpsap1Q9D0M1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prpsap1Q9D0M1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prpsap1Q9D0M1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Prpsap1Q9D0M1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prpsap1Q9D0M1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prpsap1Q9D0M1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prpsap1Q9D0M1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prpsap1Q9D0M1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prpsap1Q9D0M1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prpsap1Q9D0M1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prpsap1Q9D0M1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prpsap1Q9D0M1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prpsap1Q9D0M1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prpsap1Q9D0M1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Prpsap1Q9D0M1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prpsap1Q9D0M1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prpsap1Q9D0M1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prpsap1Q9D0M1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prpsap1Q9D0M1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prpsap1Q9D0M1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prpsap1Q9D0M1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prpsap1Q9D0M1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prpsap1Q9D0M1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prpsap1Q9D0M1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prpsap1Q9D0M1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prpsap1Q9D0M1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prpsap1Q9D0M1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prpsap1Q9D0M1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prpsap1Q9D0M1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prpsap1Q9D0M1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prpsap1Q9D0M1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prpsap1Q9D0M1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prpsap1Q9D0M1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prpsap1Q9D0M1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prpsap1Q9D0M1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prpsap1Q9D0M1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prpsap1Q9D0M1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prpsap1Q9D0M1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prpsap1Q9D0M1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prpsap1Q9D0M1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Prpsap1Q9D0M1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Prpsap1Q9D0M1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prpsap1Q9D0M1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prpsap1Q9D0M1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prpsap1Q9D0M1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prpsap1Q9D0M1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prpsap1Q9D0M1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prpsap1Q9D0M1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prpsap1Q9D0M1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prpsap1Q9D0M1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prpsap1Q9D0M1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prpsap1Q9D0M1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prpsap1Q9D0M1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prpsap1Q9D0M1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prpsap1Q9D0M1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Prpsap1Q9D0M1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prpsap1Q9D0M1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prpsap1Q9D0M1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prpsap1Q9D0M1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prpsap1Q9D0M1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prpsap1Q9D0M1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prpsap1Q9D0M1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prpsap1Q9D0M1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Prpsap1Q9D0M1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prpsap1Q9D0M1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prpsap1Q9D0M1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prpsap1Q9D0M1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prpsap1Q9D0M1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prpsap1Q9D0M1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prpsap1Q9D0M1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prpsap1Q9D0M1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prpsap1Q9D0M1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prpsap1Q9D0M1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prpsap1Q9D0M1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prpsap1Q9D0M1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prpsap1Q9D0M1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prpsap1Q9D0M1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prpsap1Q9D0M1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prpsap1Q9D0M1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prpsap1Q9D0M1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prpsap1Q9D0M1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prpsap1Q9D0M1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prpsap1Q9D0M1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prpsap1Q9D0M1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Prpsap1Q9D0M1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prpsap1Q9D0M1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prpsap1Q9D0M1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prpsap1Q9D0M1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prpsap1Q9D0M1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prpsap1Q9D0M1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prpsap1Q9D0M1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prpsap1Q9D0M1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prpsap1Q9D0M1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prpsap1Q9D0M1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prpsap1Q9D0M1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms