Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA5

Zcchc12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc12Q9CZA5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zcchc12Q9CZA5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zcchc12Q9CZA5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zcchc12Q9CZA5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zcchc12Q9CZA5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zcchc12Q9CZA5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zcchc12Q9CZA5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zcchc12Q9CZA5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zcchc12Q9CZA5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Zcchc12Q9CZA5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zcchc12Q9CZA5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zcchc12Q9CZA5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zcchc12Q9CZA5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zcchc12Q9CZA5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zcchc12Q9CZA5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zcchc12Q9CZA5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zcchc12Q9CZA5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zcchc12Q9CZA5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Zcchc12Q9CZA5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Zcchc12Q9CZA5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zcchc12Q9CZA5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zcchc12Q9CZA5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Zcchc12Q9CZA5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zcchc12Q9CZA5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zcchc12Q9CZA5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zcchc12Q9CZA5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zcchc12Q9CZA5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zcchc12Q9CZA5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Zcchc12Q9CZA5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zcchc12Q9CZA5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zcchc12Q9CZA5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zcchc12Q9CZA5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zcchc12Q9CZA5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zcchc12Q9CZA5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zcchc12Q9CZA5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zcchc12Q9CZA5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zcchc12Q9CZA5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zcchc12Q9CZA5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zcchc12Q9CZA5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zcchc12Q9CZA5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zcchc12Q9CZA5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zcchc12Q9CZA5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zcchc12Q9CZA5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zcchc12Q9CZA5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zcchc12Q9CZA5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zcchc12Q9CZA5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zcchc12Q9CZA5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zcchc12Q9CZA5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zcchc12Q9CZA5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zcchc12Q9CZA5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zcchc12Q9CZA5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zcchc12Q9CZA5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zcchc12Q9CZA5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zcchc12Q9CZA5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zcchc12Q9CZA5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zcchc12Q9CZA5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zcchc12Q9CZA5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zcchc12Q9CZA5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zcchc12Q9CZA5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zcchc12Q9CZA5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zcchc12Q9CZA5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zcchc12Q9CZA5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zcchc12Q9CZA5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zcchc12Q9CZA5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zcchc12Q9CZA5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zcchc12Q9CZA5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zcchc12Q9CZA5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Zcchc12Q9CZA5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Zcchc12Q9CZA5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Zcchc12Q9CZA5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zcchc12Q9CZA5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zcchc12Q9CZA5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zcchc12Q9CZA5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zcchc12Q9CZA5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zcchc12Q9CZA5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zcchc12Q9CZA5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zcchc12Q9CZA5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zcchc12Q9CZA5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zcchc12Q9CZA5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zcchc12Q9CZA5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zcchc12Q9CZA5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zcchc12Q9CZA5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zcchc12Q9CZA5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zcchc12Q9CZA5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zcchc12Q9CZA5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zcchc12Q9CZA5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zcchc12Q9CZA5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zcchc12Q9CZA5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zcchc12Q9CZA5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Zcchc12Q9CZA5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zcchc12Q9CZA5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zcchc12Q9CZA5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zcchc12Q9CZA5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zcchc12Q9CZA5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zcchc12Q9CZA5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zcchc12Q9CZA5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zcchc12Q9CZA5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zcchc12Q9CZA5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zcchc12Q9CZA5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zcchc12Q9CZA5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms