Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChtopQ9CY57 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChtopQ9CY57 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChtopQ9CY57 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChtopQ9CY57 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChtopQ9CY57 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChtopQ9CY57 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChtopQ9CY57 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChtopQ9CY57 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChtopQ9CY57 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChtopQ9CY57 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ChtopQ9CY57 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ChtopQ9CY57 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ChtopQ9CY57 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChtopQ9CY57 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChtopQ9CY57 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChtopQ9CY57 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChtopQ9CY57 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChtopQ9CY57 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChtopQ9CY57 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ChtopQ9CY57 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ChtopQ9CY57 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ChtopQ9CY57 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ChtopQ9CY57 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ChtopQ9CY57 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ChtopQ9CY57 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ChtopQ9CY57 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChtopQ9CY57 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChtopQ9CY57 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChtopQ9CY57 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ChtopQ9CY57 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ChtopQ9CY57 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ChtopQ9CY57 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ChtopQ9CY57 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ChtopQ9CY57 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ChtopQ9CY57 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChtopQ9CY57 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChtopQ9CY57 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChtopQ9CY57 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChtopQ9CY57 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChtopQ9CY57 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChtopQ9CY57 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChtopQ9CY57 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChtopQ9CY57 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChtopQ9CY57 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChtopQ9CY57 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChtopQ9CY57 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChtopQ9CY57 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChtopQ9CY57 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChtopQ9CY57 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChtopQ9CY57 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChtopQ9CY57 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChtopQ9CY57 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChtopQ9CY57 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ChtopQ9CY57 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ChtopQ9CY57 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ChtopQ9CY57 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ChtopQ9CY57 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ChtopQ9CY57 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ChtopQ9CY57 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ChtopQ9CY57 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ChtopQ9CY57 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ChtopQ9CY57 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ChtopQ9CY57 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ChtopQ9CY57 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ChtopQ9CY57 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ChtopQ9CY57 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ChtopQ9CY57 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ChtopQ9CY57 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ChtopQ9CY57 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ChtopQ9CY57 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ChtopQ9CY57 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ChtopQ9CY57 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ChtopQ9CY57 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ChtopQ9CY57 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ChtopQ9CY57 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ChtopQ9CY57 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ChtopQ9CY57 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ChtopQ9CY57 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ChtopQ9CY57 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ChtopQ9CY57 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ChtopQ9CY57 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChtopQ9CY57 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChtopQ9CY57 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChtopQ9CY57 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChtopQ9CY57 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChtopQ9CY57 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChtopQ9CY57 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChtopQ9CY57 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChtopQ9CY57 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChtopQ9CY57 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChtopQ9CY57 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChtopQ9CY57 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChtopQ9CY57 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChtopQ9CY57 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChtopQ9CY57 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChtopQ9CY57 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ChtopQ9CY57 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ChtopQ9CY57 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ChtopQ9CY57 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms