Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT3

Snx10, Sorting nexin-10, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx10Q9CWT3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Snx10Q9CWT3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Snx10Q9CWT3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Snx10Q9CWT3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Snx10Q9CWT3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Snx10Q9CWT3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Snx10Q9CWT3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Snx10Q9CWT3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Snx10Q9CWT3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Snx10Q9CWT3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Snx10Q9CWT3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Snx10Q9CWT3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Snx10Q9CWT3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Snx10Q9CWT3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Snx10Q9CWT3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Snx10Q9CWT3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Snx10Q9CWT3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Snx10Q9CWT3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Snx10Q9CWT3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Snx10Q9CWT3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Snx10Q9CWT3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Snx10Q9CWT3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Snx10Q9CWT3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Snx10Q9CWT3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Snx10Q9CWT3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Snx10Q9CWT3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Snx10Q9CWT3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Snx10Q9CWT3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Snx10Q9CWT3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Snx10Q9CWT3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Snx10Q9CWT3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Snx10Q9CWT3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Snx10Q9CWT3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Snx10Q9CWT3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Snx10Q9CWT3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Snx10Q9CWT3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Snx10Q9CWT3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Snx10Q9CWT3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Snx10Q9CWT3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Snx10Q9CWT3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Snx10Q9CWT3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Snx10Q9CWT3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Snx10Q9CWT3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Snx10Q9CWT3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Snx10Q9CWT3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Snx10Q9CWT3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Snx10Q9CWT3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Snx10Q9CWT3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Snx10Q9CWT3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Snx10Q9CWT3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Snx10Q9CWT3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Snx10Q9CWT3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Snx10Q9CWT3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Snx10Q9CWT3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Snx10Q9CWT3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Snx10Q9CWT3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Snx10Q9CWT3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Snx10Q9CWT3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Snx10Q9CWT3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Snx10Q9CWT3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Snx10Q9CWT3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Snx10Q9CWT3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Snx10Q9CWT3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Snx10Q9CWT3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Snx10Q9CWT3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Snx10Q9CWT3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Snx10Q9CWT3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Snx10Q9CWT3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Snx10Q9CWT3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Snx10Q9CWT3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Snx10Q9CWT3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Snx10Q9CWT3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Snx10Q9CWT3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Snx10Q9CWT3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Snx10Q9CWT3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Snx10Q9CWT3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Snx10Q9CWT3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Snx10Q9CWT3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Snx10Q9CWT3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Snx10Q9CWT3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Snx10Q9CWT3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Snx10Q9CWT3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Snx10Q9CWT3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Snx10Q9CWT3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Snx10Q9CWT3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Snx10Q9CWT3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Snx10Q9CWT3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Snx10Q9CWT3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Snx10Q9CWT3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Snx10Q9CWT3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Snx10Q9CWT3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Snx10Q9CWT3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Snx10Q9CWT3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Snx10Q9CWT3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Snx10Q9CWT3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Snx10Q9CWT3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Snx10Q9CWT3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Snx10Q9CWT3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Snx10Q9CWT3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Snx10Q9CWT3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms