Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRB9

Chchd3, MICOS complex subunit Mic19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd3Q9CRB9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chchd3Q9CRB9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chchd3Q9CRB9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chchd3Q9CRB9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chchd3Q9CRB9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chchd3Q9CRB9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chchd3Q9CRB9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chchd3Q9CRB9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chchd3Q9CRB9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chchd3Q9CRB9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chchd3Q9CRB9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chchd3Q9CRB9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Chchd3Q9CRB9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chchd3Q9CRB9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chchd3Q9CRB9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chchd3Q9CRB9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chchd3Q9CRB9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chchd3Q9CRB9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chchd3Q9CRB9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chchd3Q9CRB9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chchd3Q9CRB9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chchd3Q9CRB9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chchd3Q9CRB9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chchd3Q9CRB9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chchd3Q9CRB9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chchd3Q9CRB9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chchd3Q9CRB9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chchd3Q9CRB9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chchd3Q9CRB9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chchd3Q9CRB9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chchd3Q9CRB9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chchd3Q9CRB9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chchd3Q9CRB9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chchd3Q9CRB9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chchd3Q9CRB9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chchd3Q9CRB9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chchd3Q9CRB9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chchd3Q9CRB9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chchd3Q9CRB9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chchd3Q9CRB9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chchd3Q9CRB9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Chchd3Q9CRB9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chchd3Q9CRB9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chchd3Q9CRB9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chchd3Q9CRB9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chchd3Q9CRB9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chchd3Q9CRB9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chchd3Q9CRB9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chchd3Q9CRB9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chchd3Q9CRB9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chchd3Q9CRB9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chchd3Q9CRB9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chchd3Q9CRB9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chchd3Q9CRB9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chchd3Q9CRB9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Chchd3Q9CRB9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chchd3Q9CRB9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chchd3Q9CRB9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chchd3Q9CRB9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chchd3Q9CRB9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chchd3Q9CRB9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chchd3Q9CRB9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chchd3Q9CRB9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chchd3Q9CRB9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chchd3Q9CRB9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chchd3Q9CRB9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chchd3Q9CRB9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chchd3Q9CRB9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chchd3Q9CRB9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chchd3Q9CRB9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chchd3Q9CRB9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chchd3Q9CRB9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chchd3Q9CRB9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chchd3Q9CRB9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chchd3Q9CRB9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chchd3Q9CRB9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chchd3Q9CRB9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Chchd3Q9CRB9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chchd3Q9CRB9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chchd3Q9CRB9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chchd3Q9CRB9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chchd3Q9CRB9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chchd3Q9CRB9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chchd3Q9CRB9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chchd3Q9CRB9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chchd3Q9CRB9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chchd3Q9CRB9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chchd3Q9CRB9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chchd3Q9CRB9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chchd3Q9CRB9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chchd3Q9CRB9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chchd3Q9CRB9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Chchd3Q9CRB9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chchd3Q9CRB9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chchd3Q9CRB9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chchd3Q9CRB9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chchd3Q9CRB9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chchd3Q9CRB9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chchd3Q9CRB9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chchd3Q9CRB9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms