Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR21

Ndufab1, Acyl carrier protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufab1Q9CR21 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ndufab1Q9CR21 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ndufab1Q9CR21 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ndufab1Q9CR21 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ndufab1Q9CR21 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ndufab1Q9CR21 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ndufab1Q9CR21 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ndufab1Q9CR21 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ndufab1Q9CR21 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ndufab1Q9CR21 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Ndufab1Q9CR21 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ndufab1Q9CR21 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ndufab1Q9CR21 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ndufab1Q9CR21 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ndufab1Q9CR21 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ndufab1Q9CR21 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ndufab1Q9CR21 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ndufab1Q9CR21 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ndufab1Q9CR21 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ndufab1Q9CR21 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ndufab1Q9CR21 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ndufab1Q9CR21 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ndufab1Q9CR21 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ndufab1Q9CR21 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ndufab1Q9CR21 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ndufab1Q9CR21 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ndufab1Q9CR21 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ndufab1Q9CR21 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ndufab1Q9CR21 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ndufab1Q9CR21 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ndufab1Q9CR21 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ndufab1Q9CR21 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ndufab1Q9CR21 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ndufab1Q9CR21 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ndufab1Q9CR21 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ndufab1Q9CR21 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ndufab1Q9CR21 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ndufab1Q9CR21 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ndufab1Q9CR21 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ndufab1Q9CR21 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ndufab1Q9CR21 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ndufab1Q9CR21 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ndufab1Q9CR21 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ndufab1Q9CR21 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ndufab1Q9CR21 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ndufab1Q9CR21 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ndufab1Q9CR21 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ndufab1Q9CR21 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ndufab1Q9CR21 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ndufab1Q9CR21 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ndufab1Q9CR21 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ndufab1Q9CR21 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ndufab1Q9CR21 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ndufab1Q9CR21 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ndufab1Q9CR21 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ndufab1Q9CR21 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ndufab1Q9CR21 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ndufab1Q9CR21 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ndufab1Q9CR21 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ndufab1Q9CR21 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ndufab1Q9CR21 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ndufab1Q9CR21 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ndufab1Q9CR21 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ndufab1Q9CR21 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ndufab1Q9CR21 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ndufab1Q9CR21 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ndufab1Q9CR21 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ndufab1Q9CR21 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ndufab1Q9CR21 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ndufab1Q9CR21 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ndufab1Q9CR21 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ndufab1Q9CR21 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ndufab1Q9CR21 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ndufab1Q9CR21 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ndufab1Q9CR21 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ndufab1Q9CR21 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ndufab1Q9CR21 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ndufab1Q9CR21 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ndufab1Q9CR21 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ndufab1Q9CR21 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ndufab1Q9CR21 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ndufab1Q9CR21 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ndufab1Q9CR21 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ndufab1Q9CR21 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ndufab1Q9CR21 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ndufab1Q9CR21 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ndufab1Q9CR21 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ndufab1Q9CR21 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ndufab1Q9CR21 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ndufab1Q9CR21 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ndufab1Q9CR21 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ndufab1Q9CR21 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ndufab1Q9CR21 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ndufab1Q9CR21 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ndufab1Q9CR21 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ndufab1Q9CR21 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ndufab1Q9CR21 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ndufab1Q9CR21 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ndufab1Q9CR21 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ndufab1Q9CR21 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms