Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY8

Tm4sf20, Transmembrane 4 L6 family member 20, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm4sf20Q9CQY8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tm4sf20Q9CQY8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tm4sf20Q9CQY8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tm4sf20Q9CQY8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tm4sf20Q9CQY8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tm4sf20Q9CQY8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tm4sf20Q9CQY8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tm4sf20Q9CQY8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tm4sf20Q9CQY8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tm4sf20Q9CQY8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tm4sf20Q9CQY8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tm4sf20Q9CQY8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tm4sf20Q9CQY8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tm4sf20Q9CQY8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tm4sf20Q9CQY8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tm4sf20Q9CQY8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tm4sf20Q9CQY8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tm4sf20Q9CQY8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tm4sf20Q9CQY8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tm4sf20Q9CQY8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tm4sf20Q9CQY8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tm4sf20Q9CQY8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tm4sf20Q9CQY8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tm4sf20Q9CQY8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tm4sf20Q9CQY8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tm4sf20Q9CQY8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tm4sf20Q9CQY8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tm4sf20Q9CQY8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tm4sf20Q9CQY8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Tm4sf20Q9CQY8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tm4sf20Q9CQY8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tm4sf20Q9CQY8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tm4sf20Q9CQY8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tm4sf20Q9CQY8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tm4sf20Q9CQY8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tm4sf20Q9CQY8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tm4sf20Q9CQY8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tm4sf20Q9CQY8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tm4sf20Q9CQY8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tm4sf20Q9CQY8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tm4sf20Q9CQY8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Tm4sf20Q9CQY8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tm4sf20Q9CQY8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tm4sf20Q9CQY8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tm4sf20Q9CQY8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tm4sf20Q9CQY8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tm4sf20Q9CQY8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tm4sf20Q9CQY8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tm4sf20Q9CQY8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Tm4sf20Q9CQY8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tm4sf20Q9CQY8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tm4sf20Q9CQY8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tm4sf20Q9CQY8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tm4sf20Q9CQY8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tm4sf20Q9CQY8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tm4sf20Q9CQY8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tm4sf20Q9CQY8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tm4sf20Q9CQY8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tm4sf20Q9CQY8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tm4sf20Q9CQY8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tm4sf20Q9CQY8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tm4sf20Q9CQY8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tm4sf20Q9CQY8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tm4sf20Q9CQY8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tm4sf20Q9CQY8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tm4sf20Q9CQY8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tm4sf20Q9CQY8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tm4sf20Q9CQY8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tm4sf20Q9CQY8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tm4sf20Q9CQY8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tm4sf20Q9CQY8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tm4sf20Q9CQY8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tm4sf20Q9CQY8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tm4sf20Q9CQY8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms