Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab5aQ9CQD1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab5aQ9CQD1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab5aQ9CQD1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab5aQ9CQD1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab5aQ9CQD1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab5aQ9CQD1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rab5aQ9CQD1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Rab5aQ9CQD1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rab5aQ9CQD1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rab5aQ9CQD1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rab5aQ9CQD1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rab5aQ9CQD1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rab5aQ9CQD1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rab5aQ9CQD1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rab5aQ9CQD1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rab5aQ9CQD1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rab5aQ9CQD1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab5aQ9CQD1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab5aQ9CQD1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab5aQ9CQD1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab5aQ9CQD1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab5aQ9CQD1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rab5aQ9CQD1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rab5aQ9CQD1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rab5aQ9CQD1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rab5aQ9CQD1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rab5aQ9CQD1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab5aQ9CQD1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab5aQ9CQD1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab5aQ9CQD1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab5aQ9CQD1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab5aQ9CQD1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab5aQ9CQD1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rab5aQ9CQD1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab5aQ9CQD1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab5aQ9CQD1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab5aQ9CQD1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab5aQ9CQD1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab5aQ9CQD1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab5aQ9CQD1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab5aQ9CQD1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab5aQ9CQD1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab5aQ9CQD1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab5aQ9CQD1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab5aQ9CQD1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rab5aQ9CQD1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab5aQ9CQD1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab5aQ9CQD1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rab5aQ9CQD1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rab5aQ9CQD1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rab5aQ9CQD1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab5aQ9CQD1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab5aQ9CQD1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab5aQ9CQD1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab5aQ9CQD1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab5aQ9CQD1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab5aQ9CQD1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab5aQ9CQD1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab5aQ9CQD1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rab5aQ9CQD1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rab5aQ9CQD1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rab5aQ9CQD1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rab5aQ9CQD1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rab5aQ9CQD1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rab5aQ9CQD1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rab5aQ9CQD1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rab5aQ9CQD1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab5aQ9CQD1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab5aQ9CQD1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab5aQ9CQD1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab5aQ9CQD1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rab5aQ9CQD1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rab5aQ9CQD1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rab5aQ9CQD1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rab5aQ9CQD1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab5aQ9CQD1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab5aQ9CQD1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab5aQ9CQD1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab5aQ9CQD1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab5aQ9CQD1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rab5aQ9CQD1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab5aQ9CQD1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab5aQ9CQD1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab5aQ9CQD1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab5aQ9CQD1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab5aQ9CQD1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab5aQ9CQD1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab5aQ9CQD1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab5aQ9CQD1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab5aQ9CQD1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab5aQ9CQD1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab5aQ9CQD1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab5aQ9CQD1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab5aQ9CQD1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab5aQ9CQD1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab5aQ9CQD1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab5aQ9CQD1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab5aQ9CQD1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab5aQ9CQD1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms