Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,7■■□□□ 1,7
Rpa3Q9CQ71 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Rpa3Q9CQ71 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Rpa3Q9CQ71 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Rpa3Q9CQ71 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Rpa3Q9CQ71 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Rpa3Q9CQ71 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Rpa3Q9CQ71 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,67■■□□□ 1,7
Rpa3Q9CQ71 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Rpa3Q9CQ71 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25,67■■□□□ 1,7
Rpa3Q9CQ71 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Rpa3Q9CQ71 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Rpa3Q9CQ71 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Rpa3Q9CQ71 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25,66■■□□□ 1,7
Rpa3Q9CQ71 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25,65■■□□□ 1,7
Rpa3Q9CQ71 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
Rpa3Q9CQ71 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
Rpa3Q9CQ71 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
Rpa3Q9CQ71 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,69
Rpa3Q9CQ71 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Rpa3Q9CQ71 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Rpa3Q9CQ71 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,63■■□□□ 1,69
Rpa3Q9CQ71 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25,63■■□□□ 1,69
Rpa3Q9CQ71 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Rpa3Q9CQ71 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Rpa3Q9CQ71 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Rpa3Q9CQ71 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Rpa3Q9CQ71 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Rpa3Q9CQ71 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Rpa3Q9CQ71 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Rpa3Q9CQ71 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Rpa3Q9CQ71 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Rpa3Q9CQ71 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25,6■■□□□ 1,69
Rpa3Q9CQ71 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Rpa3Q9CQ71 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25,59■■□□□ 1,69
Rpa3Q9CQ71 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25,57■■□□□ 1,68
Rpa3Q9CQ71 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Rpa3Q9CQ71 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Rpa3Q9CQ71 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Rpa3Q9CQ71 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,54■■□□□ 1,68
Rpa3Q9CQ71 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Rpa3Q9CQ71 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,53■■□□□ 1,68
Rpa3Q9CQ71 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Rpa3Q9CQ71 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Rpa3Q9CQ71 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Rpa3Q9CQ71 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25,51■■□□□ 1,67
Rpa3Q9CQ71 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Rpa3Q9CQ71 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Rpa3Q9CQ71 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Rpa3Q9CQ71 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Rpa3Q9CQ71 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Rpa3Q9CQ71 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25,49■■□□□ 1,67
Rpa3Q9CQ71 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,49■■□□□ 1,67
Rpa3Q9CQ71 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Rpa3Q9CQ71 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Rpa3Q9CQ71 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Rpa3Q9CQ71 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Rpa3Q9CQ71 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Rpa3Q9CQ71 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Rpa3Q9CQ71 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,46■■□□□ 1,67
Rpa3Q9CQ71 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,45■■□□□ 1,67
Rpa3Q9CQ71 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Rpa3Q9CQ71 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Rpa3Q9CQ71 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Rpa3Q9CQ71 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25,44■■□□□ 1,66
Rpa3Q9CQ71 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Rpa3Q9CQ71 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Rpa3Q9CQ71 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25,43■■□□□ 1,66
Rpa3Q9CQ71 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25,43■■□□□ 1,66
Rpa3Q9CQ71 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Rpa3Q9CQ71 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Rpa3Q9CQ71 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Rpa3Q9CQ71 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Rpa3Q9CQ71 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Rpa3Q9CQ71 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Rpa3Q9CQ71 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Rpa3Q9CQ71 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Rpa3Q9CQ71 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25,4■■□□□ 1,66
Rpa3Q9CQ71 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,4■■□□□ 1,66
Rpa3Q9CQ71 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25,4■■□□□ 1,66
Rpa3Q9CQ71 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25,39■■□□□ 1,66
Rpa3Q9CQ71 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
Rpa3Q9CQ71 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,65
Rpa3Q9CQ71 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,38■■□□□ 1,65
Rpa3Q9CQ71 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,38■■□□□ 1,65
Rpa3Q9CQ71 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Rpa3Q9CQ71 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25,37■■□□□ 1,65
Rpa3Q9CQ71 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Rpa3Q9CQ71 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Rpa3Q9CQ71 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25,36■■□□□ 1,65
Rpa3Q9CQ71 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Rpa3Q9CQ71 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Rpa3Q9CQ71 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,33■■□□□ 1,65
Rpa3Q9CQ71 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25,32■■□□□ 1,64
Rpa3Q9CQ71 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Rpa3Q9CQ71 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Rpa3Q9CQ71 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25,3■■□□□ 1,64
Rpa3Q9CQ71 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Rpa3Q9CQ71 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Rpa3Q9CQ71 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25,28■■□□□ 1,64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51,5 ms