Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ45

Nenf, Neudesin, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NenfQ9CQ45 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NenfQ9CQ45 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
NenfQ9CQ45 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NenfQ9CQ45 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NenfQ9CQ45 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NenfQ9CQ45 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NenfQ9CQ45 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
NenfQ9CQ45 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NenfQ9CQ45 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NenfQ9CQ45 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NenfQ9CQ45 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NenfQ9CQ45 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NenfQ9CQ45 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
NenfQ9CQ45 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NenfQ9CQ45 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NenfQ9CQ45 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NenfQ9CQ45 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NenfQ9CQ45 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NenfQ9CQ45 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NenfQ9CQ45 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
NenfQ9CQ45 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NenfQ9CQ45 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NenfQ9CQ45 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NenfQ9CQ45 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NenfQ9CQ45 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
NenfQ9CQ45 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NenfQ9CQ45 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NenfQ9CQ45 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NenfQ9CQ45 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NenfQ9CQ45 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NenfQ9CQ45 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NenfQ9CQ45 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
NenfQ9CQ45 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NenfQ9CQ45 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NenfQ9CQ45 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NenfQ9CQ45 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NenfQ9CQ45 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NenfQ9CQ45 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NenfQ9CQ45 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
NenfQ9CQ45 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NenfQ9CQ45 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NenfQ9CQ45 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NenfQ9CQ45 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NenfQ9CQ45 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NenfQ9CQ45 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NenfQ9CQ45 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NenfQ9CQ45 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NenfQ9CQ45 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NenfQ9CQ45 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
NenfQ9CQ45 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
NenfQ9CQ45 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NenfQ9CQ45 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NenfQ9CQ45 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NenfQ9CQ45 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NenfQ9CQ45 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.56■■■□□ 2
NenfQ9CQ45 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.56■■■□□ 2
NenfQ9CQ45 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NenfQ9CQ45 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NenfQ9CQ45 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NenfQ9CQ45 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NenfQ9CQ45 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.52■■■□□ 2
NenfQ9CQ45 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NenfQ9CQ45 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NenfQ9CQ45 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NenfQ9CQ45 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NenfQ9CQ45 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NenfQ9CQ45 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NenfQ9CQ45 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NenfQ9CQ45 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NenfQ9CQ45 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NenfQ9CQ45 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NenfQ9CQ45 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NenfQ9CQ45 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NenfQ9CQ45 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NenfQ9CQ45 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NenfQ9CQ45 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NenfQ9CQ45 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NenfQ9CQ45 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NenfQ9CQ45 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NenfQ9CQ45 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NenfQ9CQ45 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NenfQ9CQ45 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NenfQ9CQ45 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NenfQ9CQ45 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NenfQ9CQ45 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NenfQ9CQ45 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NenfQ9CQ45 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NenfQ9CQ45 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NenfQ9CQ45 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NenfQ9CQ45 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NenfQ9CQ45 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NenfQ9CQ45 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NenfQ9CQ45 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NenfQ9CQ45 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NenfQ9CQ45 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NenfQ9CQ45 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NenfQ9CQ45 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NenfQ9CQ45 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NenfQ9CQ45 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NenfQ9CQ45 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms