Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,52■■■□□ 2,64
Trim26Q99PN3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,52■■■□□ 2,64
Trim26Q99PN3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,52■■■□□ 2,64
Trim26Q99PN3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,52■■■□□ 2,64
Trim26Q99PN3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,51■■■□□ 2,64
Trim26Q99PN3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,5■■■□□ 2,63
Trim26Q99PN3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC31,5■■■□□ 2,63
Trim26Q99PN3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,5■■■□□ 2,63
Trim26Q99PN3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,49■■■□□ 2,63
Trim26Q99PN3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC31,49■■■□□ 2,63
Trim26Q99PN3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC31,49■■■□□ 2,63
Trim26Q99PN3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,48■■■□□ 2,63
Trim26Q99PN3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,48■■■□□ 2,63
Trim26Q99PN3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC31,48■■■□□ 2,63
Trim26Q99PN3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,48■■■□□ 2,63
Trim26Q99PN3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,47■■■□□ 2,63
Trim26Q99PN3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,47■■■□□ 2,63
Trim26Q99PN3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,46■■■□□ 2,63
Trim26Q99PN3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,46■■■□□ 2,63
Trim26Q99PN3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,46■■■□□ 2,63
Trim26Q99PN3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,45■■■□□ 2,63
Trim26Q99PN3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC31,45■■■□□ 2,63
Trim26Q99PN3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,45■■■□□ 2,62
Trim26Q99PN3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,44■■■□□ 2,62
Trim26Q99PN3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC31,44■■■□□ 2,62
Trim26Q99PN3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,42■■■□□ 2,62
Trim26Q99PN3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC31,42■■■□□ 2,62
Trim26Q99PN3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,42■■■□□ 2,62
Trim26Q99PN3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,41■■■□□ 2,62
Trim26Q99PN3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC31,41■■■□□ 2,62
Trim26Q99PN3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,39■■■□□ 2,62
Trim26Q99PN3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC31,39■■■□□ 2,62
Trim26Q99PN3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC31,39■■■□□ 2,62
Trim26Q99PN3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,38■■■□□ 2,61
Trim26Q99PN3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,37■■■□□ 2,61
Trim26Q99PN3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,36■■■□□ 2,61
Trim26Q99PN3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC31,36■■■□□ 2,61
Trim26Q99PN3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,35■■■□□ 2,61
Trim26Q99PN3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,35■■■□□ 2,61
Trim26Q99PN3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,35■■■□□ 2,61
Trim26Q99PN3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,34■■■□□ 2,61
Trim26Q99PN3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,33■■■□□ 2,61
Trim26Q99PN3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,32■■■□□ 2,6
Trim26Q99PN3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,32■■■□□ 2,6
Trim26Q99PN3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31,32■■■□□ 2,6
Trim26Q99PN3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC31,29■■■□□ 2,6
Trim26Q99PN3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,29■■■□□ 2,6
Trim26Q99PN3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,28■■■□□ 2,6
Trim26Q99PN3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,28■■■□□ 2,6
Trim26Q99PN3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,28■■■□□ 2,6
Trim26Q99PN3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,27■■■□□ 2,6
Trim26Q99PN3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC31,27■■■□□ 2,6
Trim26Q99PN3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,27■■■□□ 2,6
Trim26Q99PN3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC31,27■■■□□ 2,6
Trim26Q99PN3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC31,27■■■□□ 2,6
Trim26Q99PN3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,26■■■□□ 2,59
Trim26Q99PN3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,26■■■□□ 2,59
Trim26Q99PN3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,26■■■□□ 2,59
Trim26Q99PN3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC31,25■■■□□ 2,59
Trim26Q99PN3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,24■■■□□ 2,59
Trim26Q99PN3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC31,23■■■□□ 2,59
Trim26Q99PN3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC31,22■■■□□ 2,59
Trim26Q99PN3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,21■■■□□ 2,59
Trim26Q99PN3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC31,21■■■□□ 2,59
Trim26Q99PN3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31,21■■■□□ 2,59
Trim26Q99PN3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,19■■■□□ 2,58
Trim26Q99PN3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC31,19■■■□□ 2,58
Trim26Q99PN3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC31,18■■■□□ 2,58
Trim26Q99PN3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,16■■■□□ 2,58
Trim26Q99PN3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,16■■■□□ 2,58
Trim26Q99PN3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,14■■■□□ 2,58
Trim26Q99PN3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC31,14■■■□□ 2,58
Trim26Q99PN3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC31,12■■■□□ 2,57
Trim26Q99PN3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC31,11■■■□□ 2,57
Trim26Q99PN3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31,1■■■□□ 2,57
Trim26Q99PN3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,1■■■□□ 2,57
Trim26Q99PN3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,09■■■□□ 2,57
Trim26Q99PN3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC31,09■■■□□ 2,57
Trim26Q99PN3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,08■■■□□ 2,57
Trim26Q99PN3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,08■■■□□ 2,57
Trim26Q99PN3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,08■■■□□ 2,57
Trim26Q99PN3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,08■■■□□ 2,57
Trim26Q99PN3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,07■■■□□ 2,57
Trim26Q99PN3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,07■■■□□ 2,56
Trim26Q99PN3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC31,07■■■□□ 2,56
Trim26Q99PN3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,07■■■□□ 2,56
Trim26Q99PN3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC31,06■■■□□ 2,56
Trim26Q99PN3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,05■■■□□ 2,56
Trim26Q99PN3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,04■■■□□ 2,56
Trim26Q99PN3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,04■■■□□ 2,56
Trim26Q99PN3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,04■■■□□ 2,56
Trim26Q99PN3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC31,04■■■□□ 2,56
Trim26Q99PN3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,03■■■□□ 2,56
Trim26Q99PN3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,03■■■□□ 2,56
Trim26Q99PN3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC31,03■■■□□ 2,56
Trim26Q99PN3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,02■■■□□ 2,56
Trim26Q99PN3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2,55
Trim26Q99PN3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC31■■■□□ 2,55
Trim26Q99PN3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,99■■■□□ 2,55
Trim26Q99PN3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,98■■■□□ 2,55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,1 ms