Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gtf2a1Q99PM3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gtf2a1Q99PM3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gtf2a1Q99PM3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Gtf2a1Q99PM3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Gtf2a1Q99PM3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Gtf2a1Q99PM3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gtf2a1Q99PM3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gtf2a1Q99PM3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gtf2a1Q99PM3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gtf2a1Q99PM3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gtf2a1Q99PM3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gtf2a1Q99PM3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Gtf2a1Q99PM3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gtf2a1Q99PM3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gtf2a1Q99PM3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gtf2a1Q99PM3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gtf2a1Q99PM3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gtf2a1Q99PM3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gtf2a1Q99PM3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gtf2a1Q99PM3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gtf2a1Q99PM3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gtf2a1Q99PM3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gtf2a1Q99PM3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gtf2a1Q99PM3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gtf2a1Q99PM3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gtf2a1Q99PM3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gtf2a1Q99PM3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gtf2a1Q99PM3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gtf2a1Q99PM3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gtf2a1Q99PM3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gtf2a1Q99PM3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gtf2a1Q99PM3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gtf2a1Q99PM3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gtf2a1Q99PM3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Gtf2a1Q99PM3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Gtf2a1Q99PM3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Gtf2a1Q99PM3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Gtf2a1Q99PM3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gtf2a1Q99PM3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gtf2a1Q99PM3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gtf2a1Q99PM3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gtf2a1Q99PM3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gtf2a1Q99PM3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Gtf2a1Q99PM3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gtf2a1Q99PM3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gtf2a1Q99PM3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gtf2a1Q99PM3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gtf2a1Q99PM3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gtf2a1Q99PM3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gtf2a1Q99PM3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gtf2a1Q99PM3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gtf2a1Q99PM3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Gtf2a1Q99PM3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gtf2a1Q99PM3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gtf2a1Q99PM3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gtf2a1Q99PM3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gtf2a1Q99PM3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gtf2a1Q99PM3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gtf2a1Q99PM3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gtf2a1Q99PM3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gtf2a1Q99PM3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gtf2a1Q99PM3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gtf2a1Q99PM3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Gtf2a1Q99PM3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Gtf2a1Q99PM3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Gtf2a1Q99PM3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Gtf2a1Q99PM3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gtf2a1Q99PM3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gtf2a1Q99PM3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gtf2a1Q99PM3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gtf2a1Q99PM3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gtf2a1Q99PM3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gtf2a1Q99PM3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gtf2a1Q99PM3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gtf2a1Q99PM3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gtf2a1Q99PM3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gtf2a1Q99PM3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Gtf2a1Q99PM3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gtf2a1Q99PM3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gtf2a1Q99PM3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gtf2a1Q99PM3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gtf2a1Q99PM3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gtf2a1Q99PM3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gtf2a1Q99PM3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gtf2a1Q99PM3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gtf2a1Q99PM3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gtf2a1Q99PM3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gtf2a1Q99PM3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gtf2a1Q99PM3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gtf2a1Q99PM3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gtf2a1Q99PM3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Gtf2a1Q99PM3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gtf2a1Q99PM3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gtf2a1Q99PM3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gtf2a1Q99PM3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gtf2a1Q99PM3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gtf2a1Q99PM3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gtf2a1Q99PM3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Gtf2a1Q99PM3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms