Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE8

Abcg5, ATP-binding cassette sub-family G member 5, mousemouse

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg5Q99PE8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcg5Q99PE8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcg5Q99PE8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcg5Q99PE8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcg5Q99PE8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcg5Q99PE8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcg5Q99PE8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcg5Q99PE8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcg5Q99PE8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcg5Q99PE8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcg5Q99PE8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcg5Q99PE8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcg5Q99PE8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcg5Q99PE8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcg5Q99PE8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcg5Q99PE8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcg5Q99PE8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcg5Q99PE8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcg5Q99PE8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcg5Q99PE8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcg5Q99PE8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcg5Q99PE8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcg5Q99PE8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcg5Q99PE8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcg5Q99PE8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcg5Q99PE8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcg5Q99PE8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcg5Q99PE8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcg5Q99PE8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcg5Q99PE8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcg5Q99PE8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcg5Q99PE8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcg5Q99PE8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcg5Q99PE8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcg5Q99PE8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcg5Q99PE8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcg5Q99PE8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcg5Q99PE8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abcg5Q99PE8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abcg5Q99PE8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abcg5Q99PE8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Abcg5Q99PE8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Abcg5Q99PE8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Abcg5Q99PE8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Abcg5Q99PE8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Abcg5Q99PE8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Abcg5Q99PE8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Abcg5Q99PE8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Abcg5Q99PE8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Abcg5Q99PE8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abcg5Q99PE8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abcg5Q99PE8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abcg5Q99PE8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcg5Q99PE8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcg5Q99PE8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcg5Q99PE8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abcg5Q99PE8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abcg5Q99PE8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abcg5Q99PE8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcg5Q99PE8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcg5Q99PE8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcg5Q99PE8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcg5Q99PE8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcg5Q99PE8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcg5Q99PE8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcg5Q99PE8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcg5Q99PE8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcg5Q99PE8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abcg5Q99PE8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abcg5Q99PE8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Abcg5Q99PE8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Abcg5Q99PE8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Abcg5Q99PE8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Abcg5Q99PE8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Abcg5Q99PE8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Abcg5Q99PE8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Abcg5Q99PE8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Abcg5Q99PE8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Abcg5Q99PE8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Abcg5Q99PE8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Abcg5Q99PE8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Abcg5Q99PE8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Abcg5Q99PE8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Abcg5Q99PE8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Abcg5Q99PE8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Abcg5Q99PE8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Abcg5Q99PE8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Abcg5Q99PE8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Abcg5Q99PE8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Abcg5Q99PE8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Abcg5Q99PE8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Abcg5Q99PE8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Abcg5Q99PE8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Abcg5Q99PE8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Abcg5Q99PE8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Abcg5Q99PE8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abcg5Q99PE8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abcg5Q99PE8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abcg5Q99PE8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Abcg5Q99PE8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms