Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GpnmbQ99P91 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GpnmbQ99P91 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GpnmbQ99P91 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GpnmbQ99P91 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GpnmbQ99P91 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GpnmbQ99P91 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GpnmbQ99P91 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GpnmbQ99P91 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GpnmbQ99P91 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GpnmbQ99P91 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GpnmbQ99P91 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GpnmbQ99P91 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GpnmbQ99P91 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GpnmbQ99P91 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GpnmbQ99P91 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GpnmbQ99P91 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GpnmbQ99P91 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GpnmbQ99P91 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GpnmbQ99P91 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GpnmbQ99P91 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GpnmbQ99P91 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GpnmbQ99P91 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GpnmbQ99P91 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GpnmbQ99P91 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GpnmbQ99P91 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GpnmbQ99P91 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GpnmbQ99P91 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GpnmbQ99P91 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GpnmbQ99P91 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GpnmbQ99P91 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GpnmbQ99P91 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GpnmbQ99P91 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GpnmbQ99P91 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GpnmbQ99P91 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GpnmbQ99P91 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GpnmbQ99P91 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GpnmbQ99P91 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GpnmbQ99P91 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GpnmbQ99P91 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GpnmbQ99P91 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GpnmbQ99P91 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GpnmbQ99P91 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GpnmbQ99P91 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GpnmbQ99P91 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GpnmbQ99P91 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GpnmbQ99P91 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GpnmbQ99P91 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GpnmbQ99P91 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GpnmbQ99P91 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GpnmbQ99P91 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GpnmbQ99P91 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GpnmbQ99P91 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GpnmbQ99P91 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GpnmbQ99P91 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GpnmbQ99P91 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GpnmbQ99P91 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GpnmbQ99P91 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GpnmbQ99P91 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GpnmbQ99P91 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GpnmbQ99P91 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GpnmbQ99P91 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GpnmbQ99P91 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GpnmbQ99P91 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GpnmbQ99P91 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GpnmbQ99P91 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GpnmbQ99P91 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GpnmbQ99P91 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GpnmbQ99P91 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GpnmbQ99P91 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GpnmbQ99P91 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GpnmbQ99P91 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GpnmbQ99P91 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GpnmbQ99P91 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GpnmbQ99P91 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GpnmbQ99P91 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GpnmbQ99P91 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GpnmbQ99P91 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GpnmbQ99P91 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GpnmbQ99P91 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GpnmbQ99P91 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GpnmbQ99P91 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GpnmbQ99P91 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GpnmbQ99P91 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GpnmbQ99P91 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GpnmbQ99P91 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GpnmbQ99P91 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GpnmbQ99P91 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GpnmbQ99P91 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GpnmbQ99P91 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GpnmbQ99P91 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GpnmbQ99P91 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GpnmbQ99P91 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GpnmbQ99P91 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GpnmbQ99P91 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GpnmbQ99P91 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GpnmbQ99P91 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GpnmbQ99P91 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GpnmbQ99P91 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GpnmbQ99P91 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms