Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB8

Ubqln4, Ubiquilin-4, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln4Q99NB8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubqln4Q99NB8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubqln4Q99NB8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubqln4Q99NB8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubqln4Q99NB8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubqln4Q99NB8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubqln4Q99NB8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubqln4Q99NB8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubqln4Q99NB8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubqln4Q99NB8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubqln4Q99NB8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubqln4Q99NB8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ubqln4Q99NB8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubqln4Q99NB8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubqln4Q99NB8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubqln4Q99NB8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubqln4Q99NB8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubqln4Q99NB8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubqln4Q99NB8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubqln4Q99NB8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubqln4Q99NB8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubqln4Q99NB8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubqln4Q99NB8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubqln4Q99NB8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubqln4Q99NB8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubqln4Q99NB8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ubqln4Q99NB8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ubqln4Q99NB8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ubqln4Q99NB8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ubqln4Q99NB8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ubqln4Q99NB8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ubqln4Q99NB8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubqln4Q99NB8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubqln4Q99NB8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubqln4Q99NB8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubqln4Q99NB8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubqln4Q99NB8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubqln4Q99NB8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubqln4Q99NB8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubqln4Q99NB8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubqln4Q99NB8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubqln4Q99NB8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ubqln4Q99NB8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ubqln4Q99NB8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ubqln4Q99NB8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ubqln4Q99NB8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ubqln4Q99NB8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ubqln4Q99NB8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ubqln4Q99NB8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ubqln4Q99NB8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ubqln4Q99NB8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubqln4Q99NB8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubqln4Q99NB8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubqln4Q99NB8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubqln4Q99NB8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ubqln4Q99NB8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ubqln4Q99NB8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ubqln4Q99NB8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubqln4Q99NB8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubqln4Q99NB8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubqln4Q99NB8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubqln4Q99NB8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubqln4Q99NB8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubqln4Q99NB8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ubqln4Q99NB8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ubqln4Q99NB8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ubqln4Q99NB8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ubqln4Q99NB8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ubqln4Q99NB8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ubqln4Q99NB8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ubqln4Q99NB8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubqln4Q99NB8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubqln4Q99NB8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ubqln4Q99NB8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ubqln4Q99NB8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ubqln4Q99NB8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ubqln4Q99NB8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ubqln4Q99NB8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubqln4Q99NB8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubqln4Q99NB8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ubqln4Q99NB8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ubqln4Q99NB8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ubqln4Q99NB8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ubqln4Q99NB8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ubqln4Q99NB8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ubqln4Q99NB8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ubqln4Q99NB8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubqln4Q99NB8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubqln4Q99NB8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ubqln4Q99NB8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ubqln4Q99NB8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ubqln4Q99NB8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ubqln4Q99NB8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ubqln4Q99NB8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ubqln4Q99NB8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubqln4Q99NB8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubqln4Q99NB8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubqln4Q99NB8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubqln4Q99NB8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubqln4Q99NB8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
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