Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Hdac9Q99N13 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Hdac9Q99N13 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Hdac9Q99N13 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Hdac9Q99N13 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Hdac9Q99N13 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Hdac9Q99N13 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Hdac9Q99N13 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Hdac9Q99N13 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Hdac9Q99N13 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Hdac9Q99N13 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Hdac9Q99N13 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Hdac9Q99N13 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Hdac9Q99N13 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Hdac9Q99N13 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Hdac9Q99N13 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Hdac9Q99N13 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Hdac9Q99N13 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Hdac9Q99N13 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Hdac9Q99N13 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Hdac9Q99N13 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Hdac9Q99N13 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Hdac9Q99N13 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Hdac9Q99N13 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Hdac9Q99N13 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Hdac9Q99N13 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Hdac9Q99N13 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Hdac9Q99N13 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Hdac9Q99N13 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Hdac9Q99N13 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Hdac9Q99N13 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Hdac9Q99N13 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Hdac9Q99N13 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Hdac9Q99N13 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Hdac9Q99N13 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Hdac9Q99N13 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Hdac9Q99N13 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Hdac9Q99N13 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Hdac9Q99N13 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Hdac9Q99N13 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Hdac9Q99N13 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Hdac9Q99N13 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Hdac9Q99N13 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Hdac9Q99N13 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Hdac9Q99N13 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Hdac9Q99N13 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Hdac9Q99N13 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Hdac9Q99N13 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Hdac9Q99N13 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Hdac9Q99N13 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Hdac9Q99N13 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Hdac9Q99N13 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Hdac9Q99N13 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Hdac9Q99N13 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Hdac9Q99N13 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Hdac9Q99N13 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Hdac9Q99N13 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Hdac9Q99N13 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Hdac9Q99N13 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Hdac9Q99N13 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Hdac9Q99N13 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Hdac9Q99N13 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Hdac9Q99N13 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Hdac9Q99N13 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Hdac9Q99N13 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Hdac9Q99N13 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Hdac9Q99N13 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Hdac9Q99N13 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Hdac9Q99N13 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Hdac9Q99N13 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Hdac9Q99N13 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Hdac9Q99N13 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Hdac9Q99N13 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Hdac9Q99N13 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Hdac9Q99N13 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Hdac9Q99N13 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Hdac9Q99N13 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Hdac9Q99N13 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Hdac9Q99N13 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Hdac9Q99N13 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Hdac9Q99N13 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Hdac9Q99N13 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Hdac9Q99N13 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Hdac9Q99N13 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Hdac9Q99N13 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Hdac9Q99N13 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Hdac9Q99N13 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Hdac9Q99N13 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Hdac9Q99N13 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Hdac9Q99N13 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Hdac9Q99N13 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Hdac9Q99N13 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Hdac9Q99N13 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Hdac9Q99N13 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Hdac9Q99N13 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Hdac9Q99N13 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Hdac9Q99N13 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Hdac9Q99N13 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Hdac9Q99N13 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Hdac9Q99N13 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms