Protein–RNA interactions for Protein: Q99M08

Uncharacterized protein C4orf3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 65 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99M08 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q99M08 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q99M08 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Q99M08 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q99M08 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Q99M08 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q99M08 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q99M08 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Q99M08 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q99M08 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q99M08 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q99M08 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q99M08 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q99M08 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q99M08 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q99M08 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q99M08 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q99M08 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Q99M08 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Q99M08 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q99M08 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q99M08 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q99M08 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q99M08 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q99M08 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q99M08 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q99M08 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q99M08 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q99M08 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q99M08 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Q99M08 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q99M08 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q99M08 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q99M08 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q99M08 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q99M08 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q99M08 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q99M08 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q99M08 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q99M08 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q99M08 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q99M08 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q99M08 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q99M08 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q99M08 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q99M08 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Q99M08 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q99M08 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q99M08 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q99M08 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q99M08 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q99M08 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Q99M08 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q99M08 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q99M08 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q99M08 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q99M08 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q99M08 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q99M08 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q99M08 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q99M08 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Q99M08 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q99M08 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q99M08 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q99M08 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q99M08 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q99M08 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q99M08 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q99M08 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q99M08 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Q99M08 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Q99M08 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q99M08 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q99M08 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q99M08 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q99M08 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q99M08 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Q99M08 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q99M08 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q99M08 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q99M08 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q99M08 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q99M08 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q99M08 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q99M08 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q99M08 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q99M08 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q99M08 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q99M08 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q99M08 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q99M08 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q99M08 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q99M08 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q99M08 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q99M08 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q99M08 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q99M08 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q99M08 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q99M08 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q99M08 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms