Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR7

Ppif, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpifQ99KR7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PpifQ99KR7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PpifQ99KR7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PpifQ99KR7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PpifQ99KR7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PpifQ99KR7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PpifQ99KR7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PpifQ99KR7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PpifQ99KR7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PpifQ99KR7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PpifQ99KR7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PpifQ99KR7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PpifQ99KR7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PpifQ99KR7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PpifQ99KR7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PpifQ99KR7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PpifQ99KR7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PpifQ99KR7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PpifQ99KR7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PpifQ99KR7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PpifQ99KR7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PpifQ99KR7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PpifQ99KR7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PpifQ99KR7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PpifQ99KR7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PpifQ99KR7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PpifQ99KR7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PpifQ99KR7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PpifQ99KR7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PpifQ99KR7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PpifQ99KR7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PpifQ99KR7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PpifQ99KR7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PpifQ99KR7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PpifQ99KR7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PpifQ99KR7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PpifQ99KR7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PpifQ99KR7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PpifQ99KR7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PpifQ99KR7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PpifQ99KR7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PpifQ99KR7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PpifQ99KR7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PpifQ99KR7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PpifQ99KR7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PpifQ99KR7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PpifQ99KR7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PpifQ99KR7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PpifQ99KR7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PpifQ99KR7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PpifQ99KR7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PpifQ99KR7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PpifQ99KR7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PpifQ99KR7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PpifQ99KR7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PpifQ99KR7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PpifQ99KR7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PpifQ99KR7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PpifQ99KR7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PpifQ99KR7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PpifQ99KR7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PpifQ99KR7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PpifQ99KR7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PpifQ99KR7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PpifQ99KR7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PpifQ99KR7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PpifQ99KR7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PpifQ99KR7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PpifQ99KR7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PpifQ99KR7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PpifQ99KR7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PpifQ99KR7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PpifQ99KR7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PpifQ99KR7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PpifQ99KR7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PpifQ99KR7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PpifQ99KR7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PpifQ99KR7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PpifQ99KR7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PpifQ99KR7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PpifQ99KR7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PpifQ99KR7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PpifQ99KR7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PpifQ99KR7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PpifQ99KR7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PpifQ99KR7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PpifQ99KR7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PpifQ99KR7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PpifQ99KR7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PpifQ99KR7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PpifQ99KR7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PpifQ99KR7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PpifQ99KR7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PpifQ99KR7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PpifQ99KR7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PpifQ99KR7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PpifQ99KR7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PpifQ99KR7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PpifQ99KR7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PpifQ99KR7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.5 ms