Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lims1Q99JW4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lims1Q99JW4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lims1Q99JW4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Lims1Q99JW4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lims1Q99JW4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lims1Q99JW4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lims1Q99JW4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lims1Q99JW4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lims1Q99JW4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lims1Q99JW4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lims1Q99JW4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lims1Q99JW4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lims1Q99JW4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lims1Q99JW4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lims1Q99JW4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lims1Q99JW4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lims1Q99JW4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lims1Q99JW4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lims1Q99JW4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lims1Q99JW4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lims1Q99JW4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lims1Q99JW4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lims1Q99JW4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lims1Q99JW4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lims1Q99JW4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lims1Q99JW4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lims1Q99JW4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lims1Q99JW4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lims1Q99JW4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lims1Q99JW4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lims1Q99JW4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lims1Q99JW4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
Lims1Q99JW4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lims1Q99JW4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lims1Q99JW4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lims1Q99JW4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lims1Q99JW4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lims1Q99JW4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lims1Q99JW4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lims1Q99JW4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lims1Q99JW4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lims1Q99JW4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lims1Q99JW4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lims1Q99JW4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lims1Q99JW4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lims1Q99JW4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lims1Q99JW4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lims1Q99JW4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lims1Q99JW4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lims1Q99JW4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Lims1Q99JW4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lims1Q99JW4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lims1Q99JW4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lims1Q99JW4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lims1Q99JW4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lims1Q99JW4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lims1Q99JW4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lims1Q99JW4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lims1Q99JW4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lims1Q99JW4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lims1Q99JW4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lims1Q99JW4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lims1Q99JW4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lims1Q99JW4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lims1Q99JW4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lims1Q99JW4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lims1Q99JW4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lims1Q99JW4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lims1Q99JW4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lims1Q99JW4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lims1Q99JW4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lims1Q99JW4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lims1Q99JW4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lims1Q99JW4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lims1Q99JW4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lims1Q99JW4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lims1Q99JW4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lims1Q99JW4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lims1Q99JW4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lims1Q99JW4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lims1Q99JW4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lims1Q99JW4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lims1Q99JW4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lims1Q99JW4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lims1Q99JW4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lims1Q99JW4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lims1Q99JW4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lims1Q99JW4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lims1Q99JW4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lims1Q99JW4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lims1Q99JW4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lims1Q99JW4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lims1Q99JW4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lims1Q99JW4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lims1Q99JW4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lims1Q99JW4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lims1Q99JW4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lims1Q99JW4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lims1Q99JW4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms