Protein–RNA interactions for Protein: Q99J87

Dhx58, Probable ATP-dependent RNA helicase DHX58, mousemouse

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dhx58Q99J87 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Dhx58Q99J87 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Dhx58Q99J87 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Dhx58Q99J87 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Dhx58Q99J87 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Dhx58Q99J87 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Dhx58Q99J87 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Dhx58Q99J87 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Dhx58Q99J87 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Dhx58Q99J87 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Dhx58Q99J87 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Dhx58Q99J87 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Dhx58Q99J87 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Dhx58Q99J87 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Dhx58Q99J87 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Dhx58Q99J87 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Dhx58Q99J87 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Dhx58Q99J87 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Dhx58Q99J87 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Dhx58Q99J87 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Dhx58Q99J87 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Dhx58Q99J87 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Dhx58Q99J87 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Dhx58Q99J87 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Dhx58Q99J87 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Dhx58Q99J87 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Dhx58Q99J87 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Dhx58Q99J87 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Dhx58Q99J87 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Dhx58Q99J87 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Dhx58Q99J87 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Dhx58Q99J87 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Dhx58Q99J87 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Dhx58Q99J87 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Dhx58Q99J87 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Dhx58Q99J87 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Dhx58Q99J87 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Dhx58Q99J87 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Dhx58Q99J87 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Dhx58Q99J87 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Dhx58Q99J87 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Dhx58Q99J87 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Dhx58Q99J87 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Dhx58Q99J87 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Dhx58Q99J87 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Dhx58Q99J87 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Dhx58Q99J87 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Dhx58Q99J87 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Dhx58Q99J87 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Dhx58Q99J87 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Dhx58Q99J87 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Dhx58Q99J87 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Dhx58Q99J87 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Dhx58Q99J87 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Dhx58Q99J87 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Dhx58Q99J87 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Dhx58Q99J87 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Dhx58Q99J87 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Dhx58Q99J87 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Dhx58Q99J87 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Dhx58Q99J87 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Dhx58Q99J87 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Dhx58Q99J87 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Dhx58Q99J87 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Dhx58Q99J87 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Dhx58Q99J87 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Dhx58Q99J87 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Dhx58Q99J87 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Dhx58Q99J87 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Dhx58Q99J87 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Dhx58Q99J87 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Dhx58Q99J87 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Dhx58Q99J87 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Dhx58Q99J87 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Dhx58Q99J87 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Dhx58Q99J87 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Dhx58Q99J87 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Dhx58Q99J87 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Dhx58Q99J87 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Dhx58Q99J87 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Dhx58Q99J87 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Dhx58Q99J87 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Dhx58Q99J87 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Dhx58Q99J87 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Dhx58Q99J87 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Dhx58Q99J87 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Dhx58Q99J87 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Dhx58Q99J87 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Dhx58Q99J87 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Dhx58Q99J87 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Dhx58Q99J87 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Dhx58Q99J87 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Dhx58Q99J87 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Dhx58Q99J87 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Dhx58Q99J87 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Dhx58Q99J87 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Dhx58Q99J87 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Dhx58Q99J87 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Dhx58Q99J87 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Dhx58Q99J87 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms