Protein–RNA interactions for Protein: Q922Q9

Chid1, Chitinase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chid1Q922Q9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chid1Q922Q9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chid1Q922Q9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chid1Q922Q9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chid1Q922Q9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chid1Q922Q9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chid1Q922Q9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chid1Q922Q9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chid1Q922Q9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chid1Q922Q9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chid1Q922Q9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Chid1Q922Q9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chid1Q922Q9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chid1Q922Q9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chid1Q922Q9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chid1Q922Q9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chid1Q922Q9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chid1Q922Q9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chid1Q922Q9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chid1Q922Q9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chid1Q922Q9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chid1Q922Q9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chid1Q922Q9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chid1Q922Q9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chid1Q922Q9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chid1Q922Q9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chid1Q922Q9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chid1Q922Q9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chid1Q922Q9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chid1Q922Q9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chid1Q922Q9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chid1Q922Q9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chid1Q922Q9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chid1Q922Q9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chid1Q922Q9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chid1Q922Q9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chid1Q922Q9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chid1Q922Q9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chid1Q922Q9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chid1Q922Q9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chid1Q922Q9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chid1Q922Q9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chid1Q922Q9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Chid1Q922Q9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chid1Q922Q9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chid1Q922Q9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chid1Q922Q9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chid1Q922Q9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chid1Q922Q9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chid1Q922Q9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chid1Q922Q9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chid1Q922Q9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chid1Q922Q9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chid1Q922Q9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chid1Q922Q9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chid1Q922Q9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chid1Q922Q9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chid1Q922Q9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chid1Q922Q9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chid1Q922Q9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chid1Q922Q9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chid1Q922Q9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chid1Q922Q9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chid1Q922Q9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chid1Q922Q9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Chid1Q922Q9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chid1Q922Q9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chid1Q922Q9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Chid1Q922Q9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chid1Q922Q9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chid1Q922Q9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chid1Q922Q9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Chid1Q922Q9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chid1Q922Q9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chid1Q922Q9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chid1Q922Q9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chid1Q922Q9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chid1Q922Q9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chid1Q922Q9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chid1Q922Q9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chid1Q922Q9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chid1Q922Q9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chid1Q922Q9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chid1Q922Q9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chid1Q922Q9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chid1Q922Q9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chid1Q922Q9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chid1Q922Q9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chid1Q922Q9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chid1Q922Q9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chid1Q922Q9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chid1Q922Q9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chid1Q922Q9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chid1Q922Q9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chid1Q922Q9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chid1Q922Q9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chid1Q922Q9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chid1Q922Q9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chid1Q922Q9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chid1Q922Q9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms