Protein–RNA interactions for Protein: Q91YE8

Synpo2, Synaptopodin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Synpo2Q91YE8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Synpo2Q91YE8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
Synpo2Q91YE8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
Synpo2Q91YE8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
Synpo2Q91YE8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,96■■□□□ 1,75
Synpo2Q91YE8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,74
Synpo2Q91YE8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Synpo2Q91YE8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,94■■□□□ 1,74
Synpo2Q91YE8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25,94■■□□□ 1,74
Synpo2Q91YE8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Synpo2Q91YE8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25,92■■□□□ 1,74
Synpo2Q91YE8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Synpo2Q91YE8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
Synpo2Q91YE8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25,9■■□□□ 1,74
Synpo2Q91YE8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25,9■■□□□ 1,74
Synpo2Q91YE8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,89■■□□□ 1,74
Synpo2Q91YE8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25,88■■□□□ 1,73
Synpo2Q91YE8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Synpo2Q91YE8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Synpo2Q91YE8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Synpo2Q91YE8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Synpo2Q91YE8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,86■■□□□ 1,73
Synpo2Q91YE8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
Synpo2Q91YE8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25,84■■□□□ 1,73
Synpo2Q91YE8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Synpo2Q91YE8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Synpo2Q91YE8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Synpo2Q91YE8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Synpo2Q91YE8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Synpo2Q91YE8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Synpo2Q91YE8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Synpo2Q91YE8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,81■■□□□ 1,72
Synpo2Q91YE8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Synpo2Q91YE8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25,81■■□□□ 1,72
Synpo2Q91YE8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Synpo2Q91YE8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,8■■□□□ 1,72
Synpo2Q91YE8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25,79■■□□□ 1,72
Synpo2Q91YE8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Synpo2Q91YE8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25,76■■□□□ 1,71
Synpo2Q91YE8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,76■■□□□ 1,71
Synpo2Q91YE8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
Synpo2Q91YE8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
Synpo2Q91YE8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25,76■■□□□ 1,71
Synpo2Q91YE8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Synpo2Q91YE8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Synpo2Q91YE8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Synpo2Q91YE8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Synpo2Q91YE8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25,72■■□□□ 1,71
Synpo2Q91YE8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Synpo2Q91YE8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25,71■■□□□ 1,71
Synpo2Q91YE8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Synpo2Q91YE8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,71
Synpo2Q91YE8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25,7■■□□□ 1,7
Synpo2Q91YE8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
Synpo2Q91YE8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
Synpo2Q91YE8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25,7■■□□□ 1,7
Synpo2Q91YE8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,68■■□□□ 1,7
Synpo2Q91YE8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Synpo2Q91YE8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Synpo2Q91YE8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Synpo2Q91YE8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Synpo2Q91YE8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Synpo2Q91YE8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Synpo2Q91YE8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
Synpo2Q91YE8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,63■■□□□ 1,69
Synpo2Q91YE8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Synpo2Q91YE8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Synpo2Q91YE8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25,63■■□□□ 1,69
Synpo2Q91YE8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Synpo2Q91YE8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Synpo2Q91YE8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Synpo2Q91YE8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Synpo2Q91YE8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25,61■■□□□ 1,69
Synpo2Q91YE8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Synpo2Q91YE8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,6■■□□□ 1,69
Synpo2Q91YE8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Synpo2Q91YE8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Synpo2Q91YE8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25,59■■□□□ 1,69
Synpo2Q91YE8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Synpo2Q91YE8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Synpo2Q91YE8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Synpo2Q91YE8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25,58■■□□□ 1,69
Synpo2Q91YE8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Synpo2Q91YE8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,57■■□□□ 1,68
Synpo2Q91YE8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25,57■■□□□ 1,68
Synpo2Q91YE8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Synpo2Q91YE8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Synpo2Q91YE8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Synpo2Q91YE8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Synpo2Q91YE8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Synpo2Q91YE8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Synpo2Q91YE8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Synpo2Q91YE8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Synpo2Q91YE8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25,53■■□□□ 1,68
Synpo2Q91YE8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Synpo2Q91YE8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25,53■■□□□ 1,68
Synpo2Q91YE8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25,53■■□□□ 1,68
Synpo2Q91YE8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Synpo2Q91YE8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Synpo2Q91YE8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25,52■■□□□ 1,68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms