Protein–RNA interactions for Protein: Q91X17

Umod, Uromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UmodQ91X17 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UmodQ91X17 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UmodQ91X17 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UmodQ91X17 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UmodQ91X17 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UmodQ91X17 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UmodQ91X17 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UmodQ91X17 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UmodQ91X17 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UmodQ91X17 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UmodQ91X17 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UmodQ91X17 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UmodQ91X17 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UmodQ91X17 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UmodQ91X17 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UmodQ91X17 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UmodQ91X17 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UmodQ91X17 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UmodQ91X17 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UmodQ91X17 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UmodQ91X17 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UmodQ91X17 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
UmodQ91X17 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UmodQ91X17 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UmodQ91X17 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UmodQ91X17 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UmodQ91X17 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UmodQ91X17 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UmodQ91X17 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UmodQ91X17 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UmodQ91X17 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UmodQ91X17 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UmodQ91X17 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UmodQ91X17 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UmodQ91X17 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UmodQ91X17 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UmodQ91X17 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UmodQ91X17 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UmodQ91X17 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
UmodQ91X17 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UmodQ91X17 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UmodQ91X17 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UmodQ91X17 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UmodQ91X17 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UmodQ91X17 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UmodQ91X17 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UmodQ91X17 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UmodQ91X17 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UmodQ91X17 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UmodQ91X17 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UmodQ91X17 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UmodQ91X17 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UmodQ91X17 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UmodQ91X17 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UmodQ91X17 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UmodQ91X17 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UmodQ91X17 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UmodQ91X17 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UmodQ91X17 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UmodQ91X17 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UmodQ91X17 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UmodQ91X17 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UmodQ91X17 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UmodQ91X17 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
UmodQ91X17 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UmodQ91X17 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UmodQ91X17 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UmodQ91X17 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UmodQ91X17 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UmodQ91X17 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UmodQ91X17 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UmodQ91X17 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UmodQ91X17 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UmodQ91X17 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UmodQ91X17 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UmodQ91X17 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UmodQ91X17 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UmodQ91X17 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UmodQ91X17 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UmodQ91X17 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
UmodQ91X17 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UmodQ91X17 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UmodQ91X17 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UmodQ91X17 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UmodQ91X17 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UmodQ91X17 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UmodQ91X17 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UmodQ91X17 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UmodQ91X17 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UmodQ91X17 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UmodQ91X17 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UmodQ91X17 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UmodQ91X17 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UmodQ91X17 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UmodQ91X17 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UmodQ91X17 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UmodQ91X17 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UmodQ91X17 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UmodQ91X17 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UmodQ91X17 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms