Protein–RNA interactions for Protein: Q91VZ6

Smap1, Stromal membrane-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smap1Q91VZ6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smap1Q91VZ6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smap1Q91VZ6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smap1Q91VZ6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smap1Q91VZ6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smap1Q91VZ6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smap1Q91VZ6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smap1Q91VZ6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smap1Q91VZ6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smap1Q91VZ6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smap1Q91VZ6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smap1Q91VZ6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Smap1Q91VZ6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smap1Q91VZ6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smap1Q91VZ6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smap1Q91VZ6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smap1Q91VZ6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smap1Q91VZ6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smap1Q91VZ6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smap1Q91VZ6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smap1Q91VZ6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smap1Q91VZ6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smap1Q91VZ6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smap1Q91VZ6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smap1Q91VZ6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smap1Q91VZ6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Smap1Q91VZ6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smap1Q91VZ6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smap1Q91VZ6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smap1Q91VZ6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smap1Q91VZ6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smap1Q91VZ6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smap1Q91VZ6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smap1Q91VZ6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smap1Q91VZ6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smap1Q91VZ6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smap1Q91VZ6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smap1Q91VZ6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smap1Q91VZ6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smap1Q91VZ6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smap1Q91VZ6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smap1Q91VZ6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smap1Q91VZ6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smap1Q91VZ6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smap1Q91VZ6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smap1Q91VZ6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smap1Q91VZ6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smap1Q91VZ6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smap1Q91VZ6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smap1Q91VZ6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smap1Q91VZ6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smap1Q91VZ6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smap1Q91VZ6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Smap1Q91VZ6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smap1Q91VZ6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smap1Q91VZ6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smap1Q91VZ6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smap1Q91VZ6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Smap1Q91VZ6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smap1Q91VZ6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smap1Q91VZ6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smap1Q91VZ6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smap1Q91VZ6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smap1Q91VZ6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smap1Q91VZ6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Smap1Q91VZ6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Smap1Q91VZ6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smap1Q91VZ6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smap1Q91VZ6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smap1Q91VZ6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smap1Q91VZ6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smap1Q91VZ6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smap1Q91VZ6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smap1Q91VZ6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smap1Q91VZ6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smap1Q91VZ6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smap1Q91VZ6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smap1Q91VZ6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smap1Q91VZ6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smap1Q91VZ6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Smap1Q91VZ6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smap1Q91VZ6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smap1Q91VZ6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smap1Q91VZ6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smap1Q91VZ6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smap1Q91VZ6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Smap1Q91VZ6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Smap1Q91VZ6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smap1Q91VZ6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smap1Q91VZ6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smap1Q91VZ6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smap1Q91VZ6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smap1Q91VZ6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smap1Q91VZ6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smap1Q91VZ6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Smap1Q91VZ6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smap1Q91VZ6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smap1Q91VZ6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smap1Q91VZ6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smap1Q91VZ6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.4 ms