Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEF1

Gramd1a, GRAM domain-containing protein 1A, mousemouse

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Length 722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gramd1aQ8VEF1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gramd1aQ8VEF1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gramd1aQ8VEF1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gramd1aQ8VEF1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gramd1aQ8VEF1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gramd1aQ8VEF1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gramd1aQ8VEF1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gramd1aQ8VEF1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gramd1aQ8VEF1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gramd1aQ8VEF1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gramd1aQ8VEF1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gramd1aQ8VEF1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gramd1aQ8VEF1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gramd1aQ8VEF1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gramd1aQ8VEF1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gramd1aQ8VEF1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gramd1aQ8VEF1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gramd1aQ8VEF1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gramd1aQ8VEF1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Gramd1aQ8VEF1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gramd1aQ8VEF1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gramd1aQ8VEF1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gramd1aQ8VEF1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gramd1aQ8VEF1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gramd1aQ8VEF1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gramd1aQ8VEF1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Gramd1aQ8VEF1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gramd1aQ8VEF1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gramd1aQ8VEF1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gramd1aQ8VEF1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gramd1aQ8VEF1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gramd1aQ8VEF1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gramd1aQ8VEF1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gramd1aQ8VEF1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gramd1aQ8VEF1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gramd1aQ8VEF1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gramd1aQ8VEF1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gramd1aQ8VEF1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gramd1aQ8VEF1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gramd1aQ8VEF1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gramd1aQ8VEF1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gramd1aQ8VEF1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gramd1aQ8VEF1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Gramd1aQ8VEF1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gramd1aQ8VEF1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gramd1aQ8VEF1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gramd1aQ8VEF1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gramd1aQ8VEF1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gramd1aQ8VEF1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gramd1aQ8VEF1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gramd1aQ8VEF1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gramd1aQ8VEF1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gramd1aQ8VEF1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gramd1aQ8VEF1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gramd1aQ8VEF1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gramd1aQ8VEF1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Gramd1aQ8VEF1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gramd1aQ8VEF1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gramd1aQ8VEF1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gramd1aQ8VEF1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gramd1aQ8VEF1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gramd1aQ8VEF1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gramd1aQ8VEF1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gramd1aQ8VEF1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gramd1aQ8VEF1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gramd1aQ8VEF1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gramd1aQ8VEF1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gramd1aQ8VEF1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Gramd1aQ8VEF1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gramd1aQ8VEF1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gramd1aQ8VEF1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gramd1aQ8VEF1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gramd1aQ8VEF1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gramd1aQ8VEF1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Gramd1aQ8VEF1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gramd1aQ8VEF1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gramd1aQ8VEF1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gramd1aQ8VEF1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gramd1aQ8VEF1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gramd1aQ8VEF1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gramd1aQ8VEF1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gramd1aQ8VEF1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gramd1aQ8VEF1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gramd1aQ8VEF1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gramd1aQ8VEF1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gramd1aQ8VEF1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gramd1aQ8VEF1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gramd1aQ8VEF1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gramd1aQ8VEF1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gramd1aQ8VEF1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gramd1aQ8VEF1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gramd1aQ8VEF1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Gramd1aQ8VEF1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gramd1aQ8VEF1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gramd1aQ8VEF1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gramd1aQ8VEF1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gramd1aQ8VEF1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gramd1aQ8VEF1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gramd1aQ8VEF1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gramd1aQ8VEF1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
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