Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDG5

Ppcs, Phosphopantothenate--cysteine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpcsQ8VDG5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
PpcsQ8VDG5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
PpcsQ8VDG5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
PpcsQ8VDG5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
PpcsQ8VDG5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
PpcsQ8VDG5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
PpcsQ8VDG5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,54■■□□□ 1,04
PpcsQ8VDG5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,54■■□□□ 1,04
PpcsQ8VDG5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,54■■□□□ 1,04
PpcsQ8VDG5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,54■■□□□ 1,04
PpcsQ8VDG5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,52■■□□□ 1,04
PpcsQ8VDG5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,52■■□□□ 1,04
PpcsQ8VDG5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,52■■□□□ 1,04
PpcsQ8VDG5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,52■■□□□ 1,03
PpcsQ8VDG5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,51■■□□□ 1,03
PpcsQ8VDG5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,51■■□□□ 1,03
PpcsQ8VDG5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,51■■□□□ 1,03
PpcsQ8VDG5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,51■■□□□ 1,03
PpcsQ8VDG5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21,51■■□□□ 1,03
PpcsQ8VDG5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,5■■□□□ 1,03
PpcsQ8VDG5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,5■■□□□ 1,03
PpcsQ8VDG5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,5■■□□□ 1,03
PpcsQ8VDG5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,49■■□□□ 1,03
PpcsQ8VDG5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21,47■■□□□ 1,03
PpcsQ8VDG5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21,47■■□□□ 1,03
PpcsQ8VDG5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21,46■■□□□ 1,03
PpcsQ8VDG5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,45■■□□□ 1,02
PpcsQ8VDG5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21,45■■□□□ 1,02
PpcsQ8VDG5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21,44■■□□□ 1,02
PpcsQ8VDG5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,43■■□□□ 1,02
PpcsQ8VDG5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
PpcsQ8VDG5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21,42■■□□□ 1,02
PpcsQ8VDG5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,42■■□□□ 1,02
PpcsQ8VDG5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,42■■□□□ 1,02
PpcsQ8VDG5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,41■■□□□ 1,02
PpcsQ8VDG5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,41■■□□□ 1,02
PpcsQ8VDG5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21,4■■□□□ 1,02
PpcsQ8VDG5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,39■■□□□ 1,01
PpcsQ8VDG5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,39■■□□□ 1,01
PpcsQ8VDG5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21,39■■□□□ 1,01
PpcsQ8VDG5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21,38■■□□□ 1,01
PpcsQ8VDG5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,38■■□□□ 1,01
PpcsQ8VDG5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,37■■□□□ 1,01
PpcsQ8VDG5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,37■■□□□ 1,01
PpcsQ8VDG5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,37■■□□□ 1,01
PpcsQ8VDG5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,36■■□□□ 1,01
PpcsQ8VDG5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,36■■□□□ 1,01
PpcsQ8VDG5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,35■■□□□ 1,01
PpcsQ8VDG5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21,35■■□□□ 1,01
PpcsQ8VDG5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,35■■□□□ 1,01
PpcsQ8VDG5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,34■■□□□ 1,01
PpcsQ8VDG5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21,34■■□□□ 1,01
PpcsQ8VDG5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,34■■□□□ 1,01
PpcsQ8VDG5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,33■■□□□ 1,01
PpcsQ8VDG5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,33■■□□□ 1
PpcsQ8VDG5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,32■■□□□ 1
PpcsQ8VDG5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,32■■□□□ 1
PpcsQ8VDG5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,32■■□□□ 1
PpcsQ8VDG5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21,32■■□□□ 1
PpcsQ8VDG5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,32■■□□□ 1
PpcsQ8VDG5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,32■■□□□ 1
PpcsQ8VDG5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21,32■■□□□ 1
PpcsQ8VDG5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21,31■■□□□ 1
PpcsQ8VDG5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,31■■□□□ 1
PpcsQ8VDG5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,31■■□□□ 1
PpcsQ8VDG5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,31■■□□□ 1
PpcsQ8VDG5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,31■■□□□ 1
PpcsQ8VDG5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,31■■□□□ 1
PpcsQ8VDG5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,3■■□□□ 1
PpcsQ8VDG5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21,3■■□□□ 1
PpcsQ8VDG5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,29■■□□□ 1
PpcsQ8VDG5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21,29■■□□□ 1
PpcsQ8VDG5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21,29■■□□□ 1
PpcsQ8VDG5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,29■■□□□ 1
PpcsQ8VDG5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,29■■□□□ 1
PpcsQ8VDG5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21,28■■□□□ 1
PpcsQ8VDG5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21,28■■□□□ 1
PpcsQ8VDG5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,28■■□□□ 1
PpcsQ8VDG5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,28■■□□□ 1
PpcsQ8VDG5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,27■■□□□ 1
PpcsQ8VDG5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21,27■■□□□ 1
PpcsQ8VDG5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,27■□□□□ 0,99
PpcsQ8VDG5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,27■□□□□ 0,99
PpcsQ8VDG5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21,26■□□□□ 0,99
PpcsQ8VDG5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21,26■□□□□ 0,99
PpcsQ8VDG5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21,25■□□□□ 0,99
PpcsQ8VDG5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,25■□□□□ 0,99
PpcsQ8VDG5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,24■□□□□ 0,99
PpcsQ8VDG5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,24■□□□□ 0,99
PpcsQ8VDG5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,23■□□□□ 0,99
PpcsQ8VDG5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21,23■□□□□ 0,99
PpcsQ8VDG5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,22■□□□□ 0,99
PpcsQ8VDG5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21,22■□□□□ 0,99
PpcsQ8VDG5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21,21■□□□□ 0,99
PpcsQ8VDG5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,21■□□□□ 0,99
PpcsQ8VDG5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,21■□□□□ 0,99
PpcsQ8VDG5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,21■□□□□ 0,99
PpcsQ8VDG5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21,21■□□□□ 0,99
PpcsQ8VDG5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,2■□□□□ 0,98
PpcsQ8VDG5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,19■□□□□ 0,98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms