Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH7

Rdh10, Retinol dehydrogenase 10, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh10Q8VCH7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rdh10Q8VCH7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rdh10Q8VCH7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rdh10Q8VCH7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rdh10Q8VCH7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rdh10Q8VCH7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Rdh10Q8VCH7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rdh10Q8VCH7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rdh10Q8VCH7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Rdh10Q8VCH7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rdh10Q8VCH7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rdh10Q8VCH7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rdh10Q8VCH7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rdh10Q8VCH7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rdh10Q8VCH7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rdh10Q8VCH7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rdh10Q8VCH7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rdh10Q8VCH7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rdh10Q8VCH7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rdh10Q8VCH7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rdh10Q8VCH7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rdh10Q8VCH7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rdh10Q8VCH7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rdh10Q8VCH7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rdh10Q8VCH7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rdh10Q8VCH7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rdh10Q8VCH7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rdh10Q8VCH7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rdh10Q8VCH7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rdh10Q8VCH7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rdh10Q8VCH7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rdh10Q8VCH7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rdh10Q8VCH7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Rdh10Q8VCH7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rdh10Q8VCH7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rdh10Q8VCH7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rdh10Q8VCH7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rdh10Q8VCH7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rdh10Q8VCH7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rdh10Q8VCH7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rdh10Q8VCH7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rdh10Q8VCH7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rdh10Q8VCH7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rdh10Q8VCH7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rdh10Q8VCH7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rdh10Q8VCH7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rdh10Q8VCH7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rdh10Q8VCH7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rdh10Q8VCH7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rdh10Q8VCH7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rdh10Q8VCH7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rdh10Q8VCH7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rdh10Q8VCH7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rdh10Q8VCH7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rdh10Q8VCH7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rdh10Q8VCH7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rdh10Q8VCH7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rdh10Q8VCH7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rdh10Q8VCH7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rdh10Q8VCH7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rdh10Q8VCH7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rdh10Q8VCH7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rdh10Q8VCH7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rdh10Q8VCH7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rdh10Q8VCH7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rdh10Q8VCH7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rdh10Q8VCH7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rdh10Q8VCH7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rdh10Q8VCH7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rdh10Q8VCH7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rdh10Q8VCH7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rdh10Q8VCH7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rdh10Q8VCH7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rdh10Q8VCH7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rdh10Q8VCH7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rdh10Q8VCH7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rdh10Q8VCH7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rdh10Q8VCH7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rdh10Q8VCH7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rdh10Q8VCH7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rdh10Q8VCH7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rdh10Q8VCH7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rdh10Q8VCH7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rdh10Q8VCH7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rdh10Q8VCH7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rdh10Q8VCH7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rdh10Q8VCH7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rdh10Q8VCH7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rdh10Q8VCH7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rdh10Q8VCH7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rdh10Q8VCH7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rdh10Q8VCH7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rdh10Q8VCH7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rdh10Q8VCH7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rdh10Q8VCH7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rdh10Q8VCH7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rdh10Q8VCH7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rdh10Q8VCH7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rdh10Q8VCH7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rdh10Q8VCH7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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