Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC31

Ccdc9, Coiled-coil domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9Q8VC31 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ccdc9Q8VC31 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccdc9Q8VC31 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ccdc9Q8VC31 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ccdc9Q8VC31 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccdc9Q8VC31 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ccdc9Q8VC31 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ccdc9Q8VC31 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ccdc9Q8VC31 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ccdc9Q8VC31 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ccdc9Q8VC31 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Ccdc9Q8VC31 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ccdc9Q8VC31 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ccdc9Q8VC31 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccdc9Q8VC31 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccdc9Q8VC31 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccdc9Q8VC31 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ccdc9Q8VC31 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc9Q8VC31 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc9Q8VC31 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc9Q8VC31 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc9Q8VC31 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc9Q8VC31 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc9Q8VC31 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc9Q8VC31 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ccdc9Q8VC31 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ccdc9Q8VC31 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ccdc9Q8VC31 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccdc9Q8VC31 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccdc9Q8VC31 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccdc9Q8VC31 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccdc9Q8VC31 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccdc9Q8VC31 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc9Q8VC31 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc9Q8VC31 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc9Q8VC31 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc9Q8VC31 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ccdc9Q8VC31 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ccdc9Q8VC31 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ccdc9Q8VC31 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Ccdc9Q8VC31 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Ccdc9Q8VC31 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccdc9Q8VC31 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccdc9Q8VC31 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccdc9Q8VC31 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccdc9Q8VC31 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccdc9Q8VC31 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccdc9Q8VC31 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccdc9Q8VC31 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccdc9Q8VC31 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccdc9Q8VC31 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ccdc9Q8VC31 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ccdc9Q8VC31 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ccdc9Q8VC31 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ccdc9Q8VC31 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccdc9Q8VC31 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccdc9Q8VC31 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ccdc9Q8VC31 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Ccdc9Q8VC31 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccdc9Q8VC31 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc9Q8VC31 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc9Q8VC31 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc9Q8VC31 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc9Q8VC31 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccdc9Q8VC31 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccdc9Q8VC31 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccdc9Q8VC31 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccdc9Q8VC31 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccdc9Q8VC31 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccdc9Q8VC31 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccdc9Q8VC31 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccdc9Q8VC31 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccdc9Q8VC31 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc9Q8VC31 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccdc9Q8VC31 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccdc9Q8VC31 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccdc9Q8VC31 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccdc9Q8VC31 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccdc9Q8VC31 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccdc9Q8VC31 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccdc9Q8VC31 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ccdc9Q8VC31 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ccdc9Q8VC31 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc9Q8VC31 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccdc9Q8VC31 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccdc9Q8VC31 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccdc9Q8VC31 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccdc9Q8VC31 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccdc9Q8VC31 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccdc9Q8VC31 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccdc9Q8VC31 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccdc9Q8VC31 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc9Q8VC31 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc9Q8VC31 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc9Q8VC31 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc9Q8VC31 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc9Q8VC31 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc9Q8VC31 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc9Q8VC31 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc9Q8VC31 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms