Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBZ3

Clptm1, Cleft lip and palate transmembrane protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clptm1Q8VBZ3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clptm1Q8VBZ3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clptm1Q8VBZ3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clptm1Q8VBZ3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clptm1Q8VBZ3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clptm1Q8VBZ3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clptm1Q8VBZ3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Clptm1Q8VBZ3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clptm1Q8VBZ3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clptm1Q8VBZ3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clptm1Q8VBZ3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clptm1Q8VBZ3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clptm1Q8VBZ3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clptm1Q8VBZ3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clptm1Q8VBZ3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clptm1Q8VBZ3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clptm1Q8VBZ3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clptm1Q8VBZ3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clptm1Q8VBZ3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clptm1Q8VBZ3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clptm1Q8VBZ3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Clptm1Q8VBZ3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clptm1Q8VBZ3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clptm1Q8VBZ3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clptm1Q8VBZ3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Clptm1Q8VBZ3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clptm1Q8VBZ3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clptm1Q8VBZ3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clptm1Q8VBZ3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clptm1Q8VBZ3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clptm1Q8VBZ3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clptm1Q8VBZ3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clptm1Q8VBZ3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clptm1Q8VBZ3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clptm1Q8VBZ3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clptm1Q8VBZ3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clptm1Q8VBZ3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clptm1Q8VBZ3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Clptm1Q8VBZ3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clptm1Q8VBZ3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clptm1Q8VBZ3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clptm1Q8VBZ3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clptm1Q8VBZ3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Clptm1Q8VBZ3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clptm1Q8VBZ3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clptm1Q8VBZ3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Clptm1Q8VBZ3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clptm1Q8VBZ3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clptm1Q8VBZ3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clptm1Q8VBZ3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clptm1Q8VBZ3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Clptm1Q8VBZ3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Clptm1Q8VBZ3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clptm1Q8VBZ3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clptm1Q8VBZ3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clptm1Q8VBZ3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clptm1Q8VBZ3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clptm1Q8VBZ3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clptm1Q8VBZ3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clptm1Q8VBZ3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clptm1Q8VBZ3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clptm1Q8VBZ3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clptm1Q8VBZ3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clptm1Q8VBZ3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clptm1Q8VBZ3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clptm1Q8VBZ3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clptm1Q8VBZ3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clptm1Q8VBZ3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Clptm1Q8VBZ3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clptm1Q8VBZ3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clptm1Q8VBZ3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clptm1Q8VBZ3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clptm1Q8VBZ3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clptm1Q8VBZ3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clptm1Q8VBZ3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clptm1Q8VBZ3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clptm1Q8VBZ3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Clptm1Q8VBZ3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clptm1Q8VBZ3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clptm1Q8VBZ3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clptm1Q8VBZ3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clptm1Q8VBZ3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clptm1Q8VBZ3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clptm1Q8VBZ3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clptm1Q8VBZ3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clptm1Q8VBZ3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clptm1Q8VBZ3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clptm1Q8VBZ3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clptm1Q8VBZ3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clptm1Q8VBZ3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clptm1Q8VBZ3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clptm1Q8VBZ3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clptm1Q8VBZ3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clptm1Q8VBZ3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clptm1Q8VBZ3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clptm1Q8VBZ3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clptm1Q8VBZ3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clptm1Q8VBZ3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clptm1Q8VBZ3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Clptm1Q8VBZ3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms