Protein–RNA interactions for Protein: Q8R332

Nup58, Nucleoporin p58/p45, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup58Q8R332 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nup58Q8R332 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nup58Q8R332 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nup58Q8R332 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nup58Q8R332 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nup58Q8R332 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nup58Q8R332 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nup58Q8R332 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nup58Q8R332 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nup58Q8R332 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Nup58Q8R332 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nup58Q8R332 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nup58Q8R332 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nup58Q8R332 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nup58Q8R332 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nup58Q8R332 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nup58Q8R332 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nup58Q8R332 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nup58Q8R332 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nup58Q8R332 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nup58Q8R332 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nup58Q8R332 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nup58Q8R332 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nup58Q8R332 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nup58Q8R332 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nup58Q8R332 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nup58Q8R332 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nup58Q8R332 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nup58Q8R332 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nup58Q8R332 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nup58Q8R332 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nup58Q8R332 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nup58Q8R332 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nup58Q8R332 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nup58Q8R332 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nup58Q8R332 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nup58Q8R332 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nup58Q8R332 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nup58Q8R332 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nup58Q8R332 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nup58Q8R332 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nup58Q8R332 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nup58Q8R332 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nup58Q8R332 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nup58Q8R332 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nup58Q8R332 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Nup58Q8R332 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nup58Q8R332 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nup58Q8R332 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nup58Q8R332 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nup58Q8R332 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nup58Q8R332 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nup58Q8R332 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nup58Q8R332 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nup58Q8R332 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nup58Q8R332 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nup58Q8R332 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nup58Q8R332 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nup58Q8R332 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nup58Q8R332 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nup58Q8R332 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nup58Q8R332 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Nup58Q8R332 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Nup58Q8R332 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nup58Q8R332 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nup58Q8R332 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Nup58Q8R332 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Nup58Q8R332 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nup58Q8R332 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nup58Q8R332 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nup58Q8R332 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nup58Q8R332 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nup58Q8R332 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nup58Q8R332 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nup58Q8R332 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nup58Q8R332 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nup58Q8R332 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nup58Q8R332 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nup58Q8R332 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nup58Q8R332 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nup58Q8R332 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nup58Q8R332 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nup58Q8R332 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nup58Q8R332 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nup58Q8R332 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nup58Q8R332 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nup58Q8R332 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nup58Q8R332 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nup58Q8R332 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Nup58Q8R332 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nup58Q8R332 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nup58Q8R332 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nup58Q8R332 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nup58Q8R332 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nup58Q8R332 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nup58Q8R332 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nup58Q8R332 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nup58Q8R332 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nup58Q8R332 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nup58Q8R332 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms