Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vmn1r200Q8R281 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vmn1r200Q8R281 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vmn1r200Q8R281 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vmn1r200Q8R281 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Vmn1r200Q8R281 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vmn1r200Q8R281 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn1r200Q8R281 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn1r200Q8R281 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vmn1r200Q8R281 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Vmn1r200Q8R281 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vmn1r200Q8R281 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vmn1r200Q8R281 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vmn1r200Q8R281 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vmn1r200Q8R281 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vmn1r200Q8R281 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vmn1r200Q8R281 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vmn1r200Q8R281 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vmn1r200Q8R281 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vmn1r200Q8R281 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vmn1r200Q8R281 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vmn1r200Q8R281 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vmn1r200Q8R281 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vmn1r200Q8R281 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vmn1r200Q8R281 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vmn1r200Q8R281 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vmn1r200Q8R281 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vmn1r200Q8R281 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vmn1r200Q8R281 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vmn1r200Q8R281 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vmn1r200Q8R281 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vmn1r200Q8R281 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vmn1r200Q8R281 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vmn1r200Q8R281 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn1r200Q8R281 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn1r200Q8R281 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn1r200Q8R281 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn1r200Q8R281 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn1r200Q8R281 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn1r200Q8R281 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn1r200Q8R281 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vmn1r200Q8R281 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vmn1r200Q8R281 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vmn1r200Q8R281 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vmn1r200Q8R281 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vmn1r200Q8R281 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vmn1r200Q8R281 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vmn1r200Q8R281 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vmn1r200Q8R281 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vmn1r200Q8R281 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn1r200Q8R281 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn1r200Q8R281 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn1r200Q8R281 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn1r200Q8R281 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn1r200Q8R281 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn1r200Q8R281 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn1r200Q8R281 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn1r200Q8R281 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn1r200Q8R281 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn1r200Q8R281 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn1r200Q8R281 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn1r200Q8R281 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn1r200Q8R281 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn1r200Q8R281 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn1r200Q8R281 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn1r200Q8R281 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn1r200Q8R281 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn1r200Q8R281 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn1r200Q8R281 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn1r200Q8R281 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn1r200Q8R281 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn1r200Q8R281 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn1r200Q8R281 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn1r200Q8R281 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn1r200Q8R281 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn1r200Q8R281 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn1r200Q8R281 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn1r200Q8R281 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn1r200Q8R281 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn1r200Q8R281 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn1r200Q8R281 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn1r200Q8R281 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn1r200Q8R281 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn1r200Q8R281 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn1r200Q8R281 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn1r200Q8R281 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn1r200Q8R281 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn1r200Q8R281 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn1r200Q8R281 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn1r200Q8R281 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn1r200Q8R281 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn1r200Q8R281 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn1r200Q8R281 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn1r200Q8R281 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn1r200Q8R281 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn1r200Q8R281 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn1r200Q8R281 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn1r200Q8R281 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn1r200Q8R281 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn1r200Q8R281 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
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