Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1H0

Hopx, Homeodomain-only protein, mousemouse

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HopxQ8R1H0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HopxQ8R1H0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HopxQ8R1H0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HopxQ8R1H0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HopxQ8R1H0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HopxQ8R1H0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HopxQ8R1H0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HopxQ8R1H0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HopxQ8R1H0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HopxQ8R1H0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HopxQ8R1H0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HopxQ8R1H0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HopxQ8R1H0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HopxQ8R1H0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HopxQ8R1H0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HopxQ8R1H0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HopxQ8R1H0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HopxQ8R1H0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HopxQ8R1H0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HopxQ8R1H0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HopxQ8R1H0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HopxQ8R1H0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HopxQ8R1H0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HopxQ8R1H0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HopxQ8R1H0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HopxQ8R1H0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HopxQ8R1H0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HopxQ8R1H0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HopxQ8R1H0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HopxQ8R1H0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HopxQ8R1H0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HopxQ8R1H0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HopxQ8R1H0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HopxQ8R1H0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HopxQ8R1H0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HopxQ8R1H0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HopxQ8R1H0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HopxQ8R1H0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HopxQ8R1H0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HopxQ8R1H0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HopxQ8R1H0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HopxQ8R1H0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HopxQ8R1H0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HopxQ8R1H0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HopxQ8R1H0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HopxQ8R1H0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HopxQ8R1H0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HopxQ8R1H0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HopxQ8R1H0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HopxQ8R1H0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HopxQ8R1H0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HopxQ8R1H0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HopxQ8R1H0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HopxQ8R1H0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HopxQ8R1H0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HopxQ8R1H0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HopxQ8R1H0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HopxQ8R1H0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HopxQ8R1H0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HopxQ8R1H0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HopxQ8R1H0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HopxQ8R1H0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HopxQ8R1H0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HopxQ8R1H0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HopxQ8R1H0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HopxQ8R1H0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HopxQ8R1H0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HopxQ8R1H0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HopxQ8R1H0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HopxQ8R1H0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HopxQ8R1H0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HopxQ8R1H0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HopxQ8R1H0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HopxQ8R1H0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HopxQ8R1H0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HopxQ8R1H0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HopxQ8R1H0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HopxQ8R1H0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HopxQ8R1H0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HopxQ8R1H0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HopxQ8R1H0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HopxQ8R1H0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HopxQ8R1H0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HopxQ8R1H0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HopxQ8R1H0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HopxQ8R1H0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HopxQ8R1H0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HopxQ8R1H0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HopxQ8R1H0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HopxQ8R1H0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HopxQ8R1H0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HopxQ8R1H0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HopxQ8R1H0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HopxQ8R1H0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HopxQ8R1H0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HopxQ8R1H0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HopxQ8R1H0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HopxQ8R1H0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HopxQ8R1H0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HopxQ8R1H0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms