Protein–RNA interactions for Protein: Q8K301

Ddx52, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX52, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx52Q8K301 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ddx52Q8K301 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ddx52Q8K301 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ddx52Q8K301 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ddx52Q8K301 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ddx52Q8K301 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ddx52Q8K301 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ddx52Q8K301 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ddx52Q8K301 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ddx52Q8K301 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ddx52Q8K301 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ddx52Q8K301 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ddx52Q8K301 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ddx52Q8K301 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ddx52Q8K301 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ddx52Q8K301 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ddx52Q8K301 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ddx52Q8K301 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ddx52Q8K301 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ddx52Q8K301 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ddx52Q8K301 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ddx52Q8K301 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ddx52Q8K301 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ddx52Q8K301 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ddx52Q8K301 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ddx52Q8K301 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ddx52Q8K301 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ddx52Q8K301 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ddx52Q8K301 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ddx52Q8K301 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ddx52Q8K301 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ddx52Q8K301 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ddx52Q8K301 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ddx52Q8K301 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ddx52Q8K301 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ddx52Q8K301 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ddx52Q8K301 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ddx52Q8K301 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ddx52Q8K301 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddx52Q8K301 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddx52Q8K301 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddx52Q8K301 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ddx52Q8K301 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ddx52Q8K301 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddx52Q8K301 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddx52Q8K301 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddx52Q8K301 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ddx52Q8K301 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ddx52Q8K301 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddx52Q8K301 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ddx52Q8K301 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ddx52Q8K301 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ddx52Q8K301 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ddx52Q8K301 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ddx52Q8K301 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ddx52Q8K301 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ddx52Q8K301 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ddx52Q8K301 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ddx52Q8K301 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ddx52Q8K301 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ddx52Q8K301 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ddx52Q8K301 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ddx52Q8K301 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddx52Q8K301 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddx52Q8K301 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddx52Q8K301 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ddx52Q8K301 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ddx52Q8K301 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ddx52Q8K301 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ddx52Q8K301 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ddx52Q8K301 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ddx52Q8K301 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ddx52Q8K301 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ddx52Q8K301 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ddx52Q8K301 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ddx52Q8K301 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ddx52Q8K301 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ddx52Q8K301 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ddx52Q8K301 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ddx52Q8K301 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ddx52Q8K301 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ddx52Q8K301 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ddx52Q8K301 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ddx52Q8K301 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ddx52Q8K301 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ddx52Q8K301 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ddx52Q8K301 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ddx52Q8K301 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ddx52Q8K301 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ddx52Q8K301 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ddx52Q8K301 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ddx52Q8K301 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ddx52Q8K301 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ddx52Q8K301 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ddx52Q8K301 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ddx52Q8K301 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ddx52Q8K301 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ddx52Q8K301 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ddx52Q8K301 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ddx52Q8K301 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms